| 1. |
- Ameur, Adam, et al.
(författare)
-
SweGen : a whole-genome data resource of genetic variability in a cross-section of the Swedish population
- 2017
-
Ingår i: European Journal of Human Genetics. - : NATURE PUBLISHING GROUP. - 1018-4813 .- 1476-5438. ; 25:11, s. 1253-1260
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Here we describe the SweGen data set, a comprehensive map of genetic variation in the Swedish population. These data represent a basic resource for clinical genetics laboratories as well as for sequencing-based association studies by providing information on genetic variant frequencies in a cohort that is well matched to national patient cohorts. To select samples for this study, we first examined the genetic structure of the Swedish population using high-density SNP-array data from a nation-wide cohort of over 10 000 Swedish-born individuals included in the Swedish Twin Registry. A total of 1000 individuals, reflecting a cross-section of the population and capturing the main genetic structure, were selected for whole-genome sequencing. Analysis pipelines were developed for automated alignment, variant calling and quality control of the sequencing data. This resulted in a genome-wide collection of aggregated variant frequencies in the Swedish population that we have made available to the scientific community through the website https://swefreq.nbis.se. A total of 29.2 million single-nucleotide variants and 3.8 million indels were detected in the 1000 samples, with 9.9 million of these variants not present in current databases. Each sample contributed with an average of 7199 individual-specific variants. In addition, an average of 8645 larger structural variants (SVs) were detected per individual, and we demonstrate that the population frequencies of these SVs can be used for efficient filtering analyses. Finally, our results show that the genetic diversity within Sweden is substantial compared with the diversity among continental European populations, underscoring the relevance of establishing a local reference data set.
|
|
| 2. |
|
|
| 3. |
- Beier, Ulrika, et al.
(författare)
-
Bedömningsgrunder för fiskfaunans status i rinnande vatten : utveckling och tillämpning av VIX
- 2007
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Ett nytt index för bedömning av ekologisk status med hjälp av fisk i rinnande vatten har utvecklats. VIX (VattendragsIndeX) kräver standardiserat elfiske. Omgivningsvariabler som också behövs är avrinningsområdesstorlek, andel sjö i avrinningsområdet, minsta avstånd till närmaste sjö uppströms eller nedströms, höjd över havet, lutning, medeltemperatur för helår respektive juli, vattendragets bredd och provtagen area. Dessutom används bedömning av ursprunglig populationstyp av öring (strömlevande, sjövandrande eller havsvandrande) för att kunna anpassa indexet utefter detta.Potentiella indikatorer som testades var de som ingick de gamla bedömningsgrunderna (FIX), europeiskt fiskindex (EFI) och dessutom sex indikatorer som testats vid utveckling av en bedömningsmodell för laxfisk i kustvattendrag (HÖL). De sex indikatorer som till slut kvarstod i indexet för bedömning av generell påverkan var sammanlagd täthet av öring och lax, andel toleranta individer, andel lithofila individer, andel toleranta arter, andel intoleranta arter och andel laxfiskarter som reproducerar sig. Separata sidoindex kunde också räknas ut för att tydligare påvisa olika typer av påverkan, det vill säga surhet, övergödning, morfologisk och hydrologisk påverkan. Där ingick bland andra en sjunde indikator, Simpsons diversitet, för hydrologisk påverkan.Fokus var inställt på att kunna finna en så tydlig separation som möjligt av påverkade lokaler (klass 3, 4, 5; måttlig, otillfredsställande respektive dålig) och opåverkade lokaler (klass 1 och 2; hög respektive god). Det färdiga indexet VIX kunde klassa 66 % av lokalerna korrekt till påverkad/opåverkad i det dataset som användes i indexutvecklingen. Då indexet tillämpades på ett oberoende dataset var andelen korrekt klassade lokaler 73 %.Indexet kan påvisa generell påverkan, surhet, övergödning och med sidoindex även morfologisk och hydrologisk påverkan. Däremot saknas i indexet fortfarande ett tydligt påvisande av påverkan på konnektivitet för fisk i vattendrag.
|
|
| 4. |
- Callaghan, Terry, et al.
(författare)
-
Multi-Decadal Changes in Tundra Environments and Ecosystems : Synthesis of the International Polar Year-Back to the Future Project (IPY-BTF)
- 2011
-
Ingår i: Ambio. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0044-7447 .- 1654-7209. ; 40:6, s. 705-716
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Understanding the responses of tundra systemsto global change has global implications. Most tundraregions lack sustained environmental monitoring and oneof the only ways to document multi-decadal change is toresample historic research sites. The International PolarYear (IPY) provided a unique opportunity for such researchthrough the Back to the Future (BTF) project (IPY project#512). This article synthesizes the results from 13 paperswithin this Ambio Special Issue. Abiotic changes includeglacial recession in the Altai Mountains, Russia; increasedsnow depth and hardness, permafrost warming, andincreased growing season length in sub-arctic Sweden;drying of ponds in Greenland; increased nutrient availabilityin Alaskan tundra ponds, and warming at mostlocations studied. Biotic changes ranged from relativelyminor plant community change at two sites in Greenland tomoderate change in the Yukon, and to dramatic increasesin shrub and tree density on Herschel Island, and in subarcticSweden. The population of geese tripled at one sitein northeast Greenland where biomass in non-grazed plotsdoubled. A model parameterized using results from a BTFstudy forecasts substantial declines in all snowbeds andincreases in shrub tundra on Niwot Ridge, Colorado overthe next century. In general, results support and provideimproved capacities for validating experimental manipulation,remote sensing, and modeling studies.
|
|
| 5. |
|
|
| 6. |
- Dahlberg, Matz, et al.
(författare)
-
Inledning
- 2013. - 1
-
Ingår i: Välfärdstjänster i privat regi. - Stockholm : SNS förlag. - 9789186949471 ; , s. 21-32
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 7. |
- Dahlberg, Matz, et al.
(författare)
-
Inledning
- 2013. - 1
-
Ingår i: Välfärdstjänster i privat regi. - Stockholm : SNS förlag. - 9789186949471 ; , s. 221-230
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- I den här antologin har vi behandlat privatiseringar inom den svenska välfärdssektorn. Sedan slutet av 1980-talet har Sverige gått från ett nästan helt offentligt produktionssystem till ett system med en blandning av offentliga och privata utförare som konkurrerar med varandra. Valfrihet för brukarna har införts på flera områden. Vi har beskrivit hur framväxten av privat välfärdsproduktion sett ut och analyserat några centrala drivkrafter bakom denna utveckling.
|
|
| 8. |
- Dahlberg, Matz, 1966-, et al.
(författare)
-
Labor market integration of refugees : RCT evidence from an early intervention program in Sweden
- 2024
-
Ingår i: Journal of Economic Behavior and Organization. - : Elsevier. - 0167-2681 .- 1879-1751. ; 217, s. 614-630
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- This study uses a randomized controlled trial to evaluate a new program for increased labor market integration of refugees. The new program starts shortly after the residence permit is granted and uses three main components: early and intensive language training, work practice with supervisors, and job search assistance performed by professional caseworkers. The immediate and intensive assistance contrasts previous integration policies which typically constitute low-intensive help over long periods of time. We find large positive effects on employment of the program, with magnitudes corresponding to around 15 percentage points. A mediation analysis shows that 7–8 percent of the impact of the program seems to be explained by increases in documented language skills. Cost estimates suggest that the new policy is less expensive than earlier labor market programs.
|
|
| 9. |
- Dahlberg, Magnus, et al.
(författare)
-
Provfiske efter flod- och signalkräfta 2005 : Specialprojekt inom ramen för IKEU
- 2005
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Vid undersökningar av försurade och kalkade vatten är sammansättningen av kräftbeståndenen viktig parameter att beakta. Både flodkräfta (Astacus astacus) och signalkräfta (Pacifastacus leniusculus) är känsliga för vattenkemiska och hydrologiska störningar i form av surstötar och hör till Sveriges mest försurningskänsliga organismer. Kräftor bedöms ha en undre tolererbar pH-gräns på mellan 5,5-6,0, men detta varierar beroende på bl.a.humushalten i sjön. Båda våra kräftarter används som indikatorer på god vattenkvalitet och försurning. Flodkräfta är dessutom en prioriterad art vid val av objekt för kalkning och biologisk återställning.Arten blev under 2005 uppflyttad från sårbar till starkt hotad enligt rödlistan för hotade arter (Gärdenfors, 2005). Den är även upptagen i EU:s habitatdirektiv. För att följa populationsutvecklingen behövs längre tidsserier av standardiserade provfisken i sjöar och vattendrag. I dagsläget har vi mycket få sådana serier där uföraren är en regional eller central myndighet. Idag görs det uppföljningar efter utsättning av flodkräftor (effektuppföljning vid återintroduktion av flodkräfta som biologisk återställning efter kalkning), men det saknas provfisken efter flod- och signalkräfta inom IKEU. Det är därför angeläget att inkludera fältundersökningar av kräftor inom IKEU programmet.I Fiskeriverkets kräftdatabas lagras och bearbetas data om kräftor i form av provfisken, förekomstuppgifter och pestuppgifter. Kräftdatabasen ger underlag för jämförelser mellanfisken, förekomster och pest på lokal, regional eller nationell nivå. Uttag i form av översiktliga provfiskerapporter (se bilagan) kan göras direkt efter inmatning.
|
|
| 10. |
- Dahlberg, Matz, et al.
(författare)
-
Slutsaster.
- 2013
-
Ingår i: Välfärdstjänster i privat regi.. - Stockholm : SNS förlag. - 9789186949471 ; , s. 221-230
-
Bokkapitel (refereegranskat)
|
|
