Sökning: WFRF:(Gidlöf Olof)
> Lindahl Bertil >
Quantitation of 87 ...
Quantitation of 87 Proteins by nLC-MRM/MS in Human Plasma : Workflow for Large-Scale Analysis of Biobank Samples
-
- Rezeli, Melinda (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Clinical Protein Science and Imaging,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups
-
- Sjödin, Karin (författare)
- H Lundbeck & Co AS, Dept Drug Metab, DK-2500 Copenhagen, Denmark.
-
- Lindberg, Henrik (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Clinical Protein Science and Imaging,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups
-
visa fler...
-
- Gidlöf, Olof (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär kardiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molecular Cardiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Lindahl, Bertil, 1957- (författare)
- Uppsala University,Uppsala universitet,Kardiologi,Uppsala kliniska forskningscentrum (UCR)
-
- Jernberg, Tomas (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Danderyd Hospital
-
- Spaak, Jonas (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Danderyd Hospital
-
- Erlinge, David (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär kardiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molecular Cardiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Marko-Varga, György (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Clinical Protein Science and Imaging,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-08-08
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Proteome Research. - : AMER CHEMICAL SOC. - 1535-3893 .- 1535-3907. ; 16:9, s. 3242-3254
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- A multiple reaction monitoring (MRM) assay was developed for precise quantitation of 87 plasma proteins including the three isoforms of apolipoprotein E (APOE) associated with cardiovascular diseases using nanoscale liquid chromatography separation and stable isotope dilution strategy. The analytical performance of the assay was evaluated and we found an average technical variation of 4.7% in 4-5 orders of magnitude dynamic range (approximate to 0.2 mg/L to 4.5 g/L) from whole plasma digest. Here, we report a complete workflow, including sample processing adapted to 96-well plate format and normalization strategy for large-scale studies. To further investigate the MS-based quantitation the amount of six selected proteins was measured by routinely used clinical chemistry assays as well and the two methods showed excellent correlation with high significance (p-value < 10e-5) for the six proteins, in addition for the cardiovascular predictor factor, APOB: APOA1 ratio (r = 0.969, p-value < 10e-5). Moreover, we utilized the developed assay for screening of biobank samples from patients with myocardial infarction and performed the comparative analysis of patient groups with STEMI (ST- segment elevation myocardial infarction), NSTEMI (non ST- segment elevation myocardial infarction) and type-2 AMI (type-2 myocardial infarction) patients.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- multiple reaction monitoring
- isotope labeled standards
- large-scale analysis
- human plasma
- protein quantitation
- human plasma
- isotope labeled standards
- large-scale analysis
- multiple reaction monitoring
- protein quantitation
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Rezeli, Melinda
-
Sjödin, Karin
-
Lindberg, Henrik
-
Gidlöf, Olof
-
Lindahl, Bertil, ...
-
Jernberg, Tomas
-
visa fler...
-
Spaak, Jonas
-
Erlinge, David
-
Marko-Varga, Gyö ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Prote ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet