Sökning: WFRF:(Klarlund Pedersen Bente)
> Kampf Caroline >
Proteome- and Trans...
Proteome- and Transcriptome-Driven Reconstruction of the Human Myocyte Metabolic Network and Its Use for Identification of Markers for Diabetes
-
Väremo, Leif (författare)
-
- Scheele, Camilla (författare)
- Köpenhamns universitet,University of Copenhagen
-
- Broholm, Christa (författare)
- Köpenhamns universitet,University of Copenhagen
-
visa fler...
-
- Mardinoglu, Adil, 1982 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Kampf, Caroline (författare)
- Uppsala universitet,Uppsala University
-
- Asplund, Anna (författare)
- Uppsala universitet,Uppsala University
-
- Nookaew, Intawat, 1977 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Uhlén, Mathias (författare)
- Uppsala universitet,KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Alba Nova Universitetscentrum,AlbaNova University Center. Stockholm Center for Physics, Astronomy and Biotechnology,Kungliga Tekniska Högskolan (KTH),Royal Institute of Technology (KTH)
-
- Pedersen, Bente Klarlund (författare)
- Köpenhamns universitet,University of Copenhagen
-
- Nielsen, Jens (författare)
- KTH,Genteknologi,Chalmers University of Technology, Sweden,Chalmers tekniska högskola
-
- Wigge, Leif, 1986 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2015
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Cell Reports. - : Elsevier BV. - 2211-1247. ; 11:6, s. 921-933
- Relaterad länk:
-
http://www.cell.com/...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
http://publications.... (primary) (free)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Skeletal myocytes are metabolically active and susceptible to insulin resistance and are thus implicated in type 2 diabetes (T2D). This complex disease involves systemic metabolic changes, and their elucidation at the systems level requires genome-wide data and biological networks. Genome-scale metabolic models (GEMs) provide a network context for the integration of high-throughput data. We generated myocyte-specific RNA-sequencing data and investigated their correlation with proteome data. These data were then used to reconstruct a comprehensive myocyte GEM. Next, we performed a meta-analysis of six studies comparing muscle transcription in T2D versus healthy subjects. Transcriptional changes were mapped on the myocyte GEM, revealing extensive transcriptional regulation in T2D, particularly around pyruvate oxidation, branched-chain amino acid catabolism, and tetrahydrofolate metabolism, connected through the downregulated dihydrolipoamide dehydrogenase. Strikingly, the gene signature underlying this metabolic regulation successfully classifies the disease state of individual samples, suggesting that regulation of these pathways is a ubiquitous feature of myocytes in response to T2D.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Cellbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Gene-Set Analysis
- Insulin-Resistance
- Skeletal-Muscle
- Expression Data
- Oxidative-Phosphorylation
- Amino-Acids
- Integration
- Obesity
- Quantification
- Hyperglycemia
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Väremo, Leif
-
Scheele, Camilla
-
Broholm, Christa
-
Mardinoglu, Adil ...
-
Kampf, Caroline
-
Asplund, Anna
-
visa fler...
-
Nookaew, Intawat ...
-
Uhlén, Mathias
-
Pedersen, Bente ...
-
Nielsen, Jens
-
Wigge, Leif, 198 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Cellbiologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Cell Reports
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Uppsala universitet
-
Chalmers tekniska högskola