| 1. |
- Bai, Xiangning, et al.
(författare)
-
Genomic Insights Into Clinical Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Strains: A 15-Year Period Survey in Jonkoping, Sweden
- 2021
-
Ingår i: Frontiers in Microbiology. - : FRONTIERS MEDIA SA. - 1664-302X. ; 12
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are important foodborne pathogens that can cause human infections ranging from asymptomatic carriage to bloody diarrhea (BD) and fatal hemolytic uremic syndrome (HUS). However, the molecular mechanism of STEC pathogenesis is not entirely known. Here, we demonstrated a large scale of molecular epidemiology and in-depth genomic study of clinical STEC isolates utilizing clinical and epidemiological data collected in Region Jonkoping County, Sweden, over a 15-year period. Out of 184 STEC isolates recovered from distinct patients, 55 were from patients with BD, and 129 were from individuals with non-bloody stools (NBS). Five individuals developed HUS. Adults were more associated with BD. Serotypes O157:H7, O26:H11, O103:H2, O121:H19, and O104:H4 were more often associated with BD. The presence of Shiga toxin-encoding gene subtypes stx(2a), stx(2a) + stx(2c), and stx(1a) + stx(2c) was associated with BD, while stx(1)(a) was associated with milder disease. Multiplex virulence and accessory genes were correlated with BD; these genes encode toxins, adhesion, autotransporters, invasion, and secretion system. A number of antimicrobial resistance (AMR) genes, such as aminoglycoside, aminocoumarin, macrolide, and fluoroquinolone resistance genes, were prevalent among clinical STEC isolates. Whole-genome phylogeny revealed that O157 and non-O157 STEC isolates evolved from distinct lineages with a few exceptions. Isolates from BD showed more tendency to cluster closely. In conclusion, this study unravels molecular trait of clinical STEC strains and identifies genetic factors associated with severe clinical outcomes, which could contribute to management of STEC infections and disease progression if confirmed by further functional validation.
|
|
| 2. |
- Berglund, Sara, et al.
(författare)
-
Gömd, glömd och fördömd
- 2002
-
Ingår i: Öresundsbron på uppmärksamhetens marknad. Regionbyggare i evenemangsbranschen. - 9144040784
-
Bokkapitel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
|
|
| 3. |
|
|
| 4. |
- Börjesson, Stefan, 1979-, et al.
(författare)
-
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in municipal wastewater : An uncharted threat?
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Methicillin-resistant S. aureus (MRSA) was recently detected in municipal wastewater, why there is a need for further studies to elucidate if MRSA in wastewater constitutes a health risk, and to determine how wastewater treatment processes affects MRSA. We cultivated MRSA from a full-scale wastewater treatment plant to characterise the indigenous MRSA-flora and to investigate how the wastewater treatment process affects the clonal distribution. MRSA isolates were characterised using spa typing, antibiograms, SSCmec typing and detection of Panton Valentine leukocidin (PVL) genes. We found that the wastewater MRSA-flora has a close genetic relationship to clinical isolates, but we also isolated novel spa types, primarily from the activated sludge treatment step. The number of isolates and the diversity of MRSA are reduced by the treatment process, but the process also selects for more extensive antibiotic resistant strains as well as for PVL positive strains.
|
|
| 5. |
- Dahl, Martin, 1984-, et al.
(författare)
-
A 2,000-Year Record of Eelgrass (Zostera marina L.) : Colonization Shows Substantial Gains in Blue Carbon Storage and Nutrient Retention
- 2024
-
Ingår i: Global Biogeochemical Cycles. - : John Wiley & Sons. - 0886-6236 .- 1944-9224. ; 38:3
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Assessing historical environmental conditions linked to habitat colonization is important for understanding long-term resilience and improving conservation and restoration efforts. Such information is lacking for the seagrass Zostera marina, an important foundation species across cold-temperate coastal areas of the Northern Hemisphere. Here, we reconstructed environmental conditions during the last 14,000 years from sediment cores in two eelgrass (Z. marina) meadows along the Swedish west coast, with the main aims to identify the time frame of seagrass colonization and describe subsequent biogeochemical changes following establishment. Based on vegetation proxies (lipid biomarkers), eelgrass colonization occurred about 2,000 years ago after geomorphological changes that resulted in a shallow, sheltered environment favoring seagrass growth. Seagrass establishment led to up to 20- and 24-fold increases in sedimentary carbon and nitrogen accumulation rates, respectively. This demonstrates the capacity of seagrasses as efficient ecosystem engineers and their role in global change mitigation and adaptation through CO2 removal, and nutrient and sediment retention. By combining regional climate projections and landscape models, we assessed potential climate change effects on seagrass growth, productivity and distribution until 2100. These predictions showed that seagrass meadows are mostly at risk from increased sedimentation and hydrodynamic changes, while the impact from sea level rise alone might be of less importance in the studied area. This study showcases the positive feedback between seagrass colonization and environmental conditions, which holds promise for successful conservation and restoration efforts aimed at supporting climate change mitigation and adaptation, and the provision of several other crucial ecosystem services. © 2024. The Authors.
|
|
| 6. |
|
|
| 7. |
|
|
| 8. |
- Davoudi, Sara
(författare)
-
What happened with the leviathan of the Public Sector? : The challenges of vertical coordination in regional public organizations and its effect on public value
- 2021
-
Doktorsavhandling (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Putting the capability to satisfy citizens’ needs at the heart of public organizations, public value has been argued to be the ultimate goal of public sector programs and policies. However, the contemporary public sector’s complex and multilevel structures has led to limited information processing between the various levels within organizations. Such vertical fragmentation has created issues in vertical coordination, hampering the efficiency and effectiveness of the regional public sector. Addressing these issues, the aim of this thesis is twofold. First, this thesis aims to describe and explain public organizations’ coordination challenges. Second, this thesis aims to elaborate on the implications of this explanation to create a deeper understanding of how these challenges affect public organizations’ ability to perform public service that adds to public value. In order to reach the aim, quantitative and qualitative methods have been used. The empirical base consists of two questionnaire studies (930 public transport users in the first and 921 in the second), as well as a comprehensive interview and documentation study with 11 respondents representing 11 Regional Public Transport Authorities and their respective policy documents. In this thesis, I argue that vertical specialization has brought conditions where each level interprets the regulations and policy documents based on their own individual preconditions such as individual ideologies and self-interests, as well as attitudes and relationships between different divisions. As such, these preconditions influence the outcome of rules and regulations that were created with the purpose of reforming the public sector. Further, the thesis outlines how the same individual precondition may act as a structural filter on the flow of information about citizens’ needs, influencing the distribution of information upstream in the organization. If we neglect these conditions and focus only on the rules and regulations, we risk missing aspects that influence the organization and its coordination outcome and, in turn, the citizen.
|
|
| 9. |
- Delgado-Vega, Angelica, et al.
(författare)
-
Recent findings on genetics of systemic autoimmune diseases
- 2010
-
Ingår i: Current Opinion in Immunology. - : Elsevier BV. - 0952-7915 .- 1879-0372. ; 22:6, s. 698-705
-
Forskningsöversikt (refereegranskat)abstract
- Association studies of over 1 million SNPs capturing most of the human genome common variation became possible thanks to the information provided by the HapMap International project and the development of high-throughput genotyping technologies at accessible prices. Genome-wide scans analyzing thousands of individuals have now identified most if not all of the major genes involved in susceptibility for several systemic autoimmune diseases. In particular, results for rheumatoid arthritis (RA), systemic lupus erythematosus (SLE), and systemic sclerosis (SSc) are reviewed here. While most genes are shared between diseases, few seem to be unique reflecting that we still are long before knowing all genes, their interactions with other genes and the environment and their impact on biological functions.
|
|
| 10. |
- Ejhed, Helene, et al.
(författare)
-
Belastning och påverkan från dagvatten : Källor till föroreningar i dagvatten, potentiell effekt, och jämförelser med belastning från andra källor
- 2018
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- SMED har på uppdrag av Naturvårdsverket tagit fram denna rapport om föroreningar och belastning från dagvatten. Studien är en del av ett Regeringsuppdrag ”Föreslå etappmål om dagvatten”. Syftet med projektet har varit att ta fram en sammanställning om belastning av föroreningar från dagvatten till vattenrecipienter. Primära källor, potentiella toxiska och hormonstörande effekter samt belastning på ytvatten har sammanställts och beräknats av ett urval av prioriterade ämnen och Särskilda Förorenande Ämnen (SFÄ) och omfattande sammanlagt 22 st näringsämnen, metaller och organiska miljöföroreningar. Dessa ämnen valdes ut eftersom de är kända ämnen i dagvatten, prioriterade ämnen av Vattenmyndigheterna på grund av att de orsakar att god kemisk eller ekologisk status inte uppnås i många vattenförekomster samt att det var möjligt att göra beräkningar av belastning av dessa tack vare att det fanns data tillgängligt. Dessa 22 ämnen har sådana ekologiska, toxiska och/eller hormonstörande effekter i akvatisk miljö att belastningen av samtliga av dessa ämnen bör begränsas eller helt förhindras. Dagvattnets påverkan och effekter på miljön har sammanställts utifrån tillgänglig litteratur. Studierna är dock få och av varierande karaktär, vilket gör det svårt att dra några generella slutsatser gällande dagvattnet påverkan.Antalet föroreningar i dagvatten kan dock vara många fler än de 22 utvalda ämnena. Uppmätta halter i dagvatten har sammanställts från Naturvårdsverkets Screeningdatabas i denna rapport och visar att 74 st ämnen förekommer i samtliga prover av dagvatten där de har analyserats, och ytterligare 117 st ämnen förekommer i en del av dagvattenproverna. Många är ämnen som ännu inte är prioriterade av vattenförvaltningen. Bland annat förekommer ofta metaller och grundämnen, vissa dioxiner och furaner, alkylfenoler, antioxidanter, bekämpningsmedel, kolväten, LAS (Linear alkyl benzene sulfonate) och olika flamskyddsmedel. Resultat av belastningsberäkningarna visar att dagvatten är en betydande spridningsväg till belastningen i recipienter för vissa ämnen trots att arealen tätort är mindre än 1% av Sveriges totala yta. För metallerna kadmium, zink, bly och koppar så har bidragen från dagvatten beräknats till mellan 15% och 17% av den totala belastningen till recipienter i Sverige och kan anses vara betydande belastning. I mellan 451 och 1090 st enskilda vattenförekomstområden är belastningen från dagvatten den dominerande spridningsvägen (>50% av total belastning) till de olika metallerna. Dagvatten utgör 100% av belastningen i 17 st vattenförekomster för koppar, zink och bly, i 12 st vattenförekomster för kadmium och nickel och i enbart 3 st vattenförekomster för kvicksilver. För de organiska ämnena är uppgifterna om utsläpp väldigt osäkra eller saknas helt för många källor till total belastning i Sverige, så som läckage från olika marktyper, jordbruksmark och skog, men de tillgängliga data och beräkningarna som gjorts indikerar att dagvatten utgör en viktig spridningsväg för PAH16, DEHP, Nonylfenol, HCH, TBT, PBDE, PFOS och PCB7 till vattenrecipienter.Betydande bidrag (>25%) till belastningen i dagvatten kommer ifrån mark inom tätorter som används till ”industri, handelsplats, grus- och sandtag, hamn och deponiverksamhet” för samtliga metaller, för nonylfenol (58%), PFOS (54%), PAH16 (40%), HCH (23%), PCB7 (23%), PBDE (22%) och oktylfenol (18%). Industri och handelsplats utgör den största arealen inom den markanvändningsklassen och bör prioriteras i det fortsatta arbetet. Industri och handelsplatser har höga typhalter och höga avrinningskoefficienter som orsakar den höga belastningen. Belastningen i dagvatten av ftalaten DEHP kommer däremot till största del ifrån ytor av ”enstaka hus, mycket grönyta” (35%), ”bostadsområde, mindre grönyta” (29%) samt ”urbant grönområde, idrottsanläggning, flygfält gräs” (25%). Markanvändningsklassen ”enstaka hus, mycket grönyta” utgör den största arealen totalt inom tätorter i Sverige (35% av arean), vilket innebär att den ytan bidrar med generellt stor belastning.Det finns stora osäkerheter i resultaten beroende bland annat på brist på mätningar av ämnen i dagvatten. Beräkningarna i denna rapport baseras på markanvändning som sammanställts av SMED till HELCOM Pollution Load Compilation (PLC7) rapporteringen, typhalter och avrinningskoefficienter inom tätorter från Stormtac databasen samt rapporterade utsläpp i miljörapporter från avloppsreningsverk och industrier i Svenska Miljörapporteringsportalen. Framförallt för organiska ämnen är dataunderlaget litet, vilket gör dessa uppskattningar mer osäkra. Utökad miljöövervakning av metaller och organiska ämnen behövs för att kunna följa trender och sätta in rätt åtgärder uppströms vid källorna och nedströms genom rening av dagvatten.Det stora antalet ämnen som har uppmätts i dagvatten och den betydande belastningen som dagvatten har beräknats bidra med, indikerar trots osäkerheterna på att miljöproblemen med dagvatten kan vara omfattande. Påverkan i form av eventuella överskridanden av miljökvalitetsnormer i recipienterna har inte kunnat beräknas inom ramen för detta projekt.
|
|
