| 1. |
- Harbst, Katja, et al.
(författare)
-
Molecular and genetic diversity in the metastatic process of melanoma.
- 2014
-
Ingår i: Journal of Pathology. - : Wiley. - 0022-3417 .- 1096-9896. ; 233:1, s. 39-50
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Diversity between metastatic melanoma tumours in individual patients is known; however, the molecular and genetic differences remain unclear. To examine the molecular and genetic differences between metastatic tumours, we performed gene-expression profiling of 63 melanoma tumours obtained from 28 patients (two or three tumours/patient), followed by analysis of their mutational landscape, using targeted deep sequencing of 1697 cancer genes and DNA copy number analysis. Gene-expression signatures revealed discordant phenotypes between tumour lesions within a patient in 50% of the cases. In 18 of 22 patients (where matched normal tissue was available), we found that the multiple lesions within a patient were genetically divergent, with one or more melanoma tumours harbouring 'private' somatic mutations. In one case, the distant subcutaneous metastasis of one patient occurring 3 months after an earlier regional lymph node metastasis had acquired 37 new coding sequence mutations, including mutations in PTEN and CDH1. However, BRAF and NRAS mutations, when present in the first metastasis, were always preserved in subsequent metastases. The patterns of nucleotide substitutions found in this study indicate an influence of UV radiation but possibly also DNA alkylating agents. Our results clearly demonstrate that metastatic melanoma is a molecularly highly heterogeneous disease that continues to progress throughout its clinical course. The private aberrations observed on a background of shared aberrations within a patient provide evidence of continued evolution of individual tumours following divergence from a common parental clone, and might have implications for personalized medicine strategies in melanoma treatment. Published by John Wiley & Sons, Ltd. www.pathsoc.org.uk.
|
|
| 2. |
- Lindow, Helma, et al.
(författare)
-
Integrerat kustzonsystem för Bohusläns skärgård
- 2004
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- SMHI har i samarbete med Länsstyrelsen i västra Götaland implementerat Kustzonssystemet i Bohusläns skärgård. Arbetet har pga. av sin omfattning indelats i två etapper. Kustzonssystemet är ett integrerat modellsystem där belastningen på kusten från land och atmosfär fastställs m.h.a. modeller. Syftet med kustzonssystemet är att modellerna skall vara så enkla som möjligt, för att kunna skapa långa tidsserier, och samtidigt kunna beskriva miljötillståndet i skärgården tillräckligt väl så att modellsystemet kan användas för exempelvis scenarioberäkningar. Bohuskusten kännetecknas av ett, på sina håll, komplicerat fjordsystem. Kustzonsmodellen är en s.k. en-dimensionell modell, som löser upp modellvariablerna i djupled, men beräknar ett horisontellt medelvärde i sitt område. För att kunna lösa upp de horisontella gradienterna i området måste modellområdet delas in i flertalet delbassänger. Indelningen av Kustzonsmodellens delbassänger följer i stort sett SVAR-indelningen. Detta innebär att för den norra delen av skärgården består modellen av 30 delbassänger. I den södra delen har vissa förenklingar kunnat göras, och några havsområden har kunnat slås samman i modellen och behandlats som en delbassäng. Genom dessa sammanslagningar har den södra skärgården delats in i 27 delbassänger. Modellen har simulerat en längre tidsserie i båda områdena. Observationer i Skagerack och Kattegatt driver modellen från öppna havet. En omfattande validering av modellen har genomförts m.h.a. observationer från Bohuskustens kontrollprogram. Därefter har in- och utflöden beräknats i varje bassäng för såväl total-kväve som total-fosfor.
|
|
| 3. |
- Marmefelt, Eleonor, et al.
(författare)
-
Integrerat kustzonsystem för Hallandskusten
- 2005
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- SMHI har i samarbete med Länsstyrelsen i Hallands län implementerat SMHIs Kustzonssystem längs Hallandskusten från Onsala kustvatten i norr till Skälderviken i söder. Kustzonssystemet är ett integrerat modellsystem där såväl belastningen på kusten från land och atmosfär som tillståndet i kustzonen beräknas med hjälp av modeller. Tillrinningen från land har beräknats med hjälp av den hydrologiska modellen HBV och koncentrationerna har fastställts med hjälp av observerade data. Atmosfärsdepositionen både på land och i kustområdet beräknas av den atmosfärskemiska MATCH-modellen. Kustzonsmodellen (PROBE-SCOBI), som är en biogeokemisk modell, beräknar tillståndet i kustvattnen. Syftet med Kustzonssystemet är att modellerna skall vara så beskaffade att det är möjligt att skapa långa tidsserier främst av näringsämnen och syrgashalt, samtidigt som miljötillståndet i kustzonen genom modellerna beskrivs med så hög kvalité att modellsystemet kan användas i analyssyfte, exempelvis vid scenariostudier. Kustzonsmodellen är en s.k. en-dimensionell modell, som löser upp modellvariablerna i djupled med hög noggrannhet, men beräknar ett horisontellt medelvärde i sitt område. För att kunna lösa upp de horisontella gradienterna i området måste modellområdet delas in i flertalet delbassänger. Beräkningar görs i alla bassänger, vilka är kopplade med varandra och utbyter egenskaper mellan varandra. Indelningen av Kustzonsmodellens delbassänger längs Hallandskusten följer SVAR-indelningen. Detta innebär att Kustzonsmodellen längs Hallandskusten består av 20 delbassänger.
|
|
| 4. |
- Sundström, Johan, Professor, 1971-, et al.
(författare)
-
Risk factors for subarachnoid haemorrhage : a nationwide cohort of 950 000 adults
- 2019
-
Ingår i: International Journal of Epidemiology. - : Oxford University Press. - 0300-5771 .- 1464-3685. ; 48:6, s. 2018-2025
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- BACKGROUND: Subarachnoid haemorrhage (SAH) is a devastating disease, with high mortality rate and substantial disability among survivors. Its causes are poorly understood. We aimed to investigate risk factors for SAH using a novel nationwide cohort consortium.METHODS: We obtained individual participant data of 949 683 persons (330 334 women) between 25 and 90 years old, with no history of SAH at baseline, from 21 population-based cohorts. Outcomes were obtained from the Swedish Patient and Causes of Death Registries.RESULTS: During 13 704 959 person-years of follow-up, 2659 cases of first-ever fatal or non-fatal SAH occurred, with an age-standardized incidence rate of 9.0 [95% confidence interval (CI) (7.4-10.6)/100 000 person-years] in men and 13.8 [(11.4-16.2)/100 000 person-years] in women. The incidence rate increased exponentially with higher age. In multivariable-adjusted Poisson models, marked sex interactions for current smoking and body mass index (BMI) were observed. Current smoking conferred a rate ratio (RR) of 2.24 (95% CI 1.95-2.57) in women and 1.62 (1.47-1.79) in men. One standard deviation higher BMI was associated with an RR of 0.86 (0.81-0.92) in women and 1.02 (0.96-1.08) in men. Higher blood pressure and lower education level were also associated with higher risk of SAH.CONCLUSIONS: The risk of SAH is 45% higher in women than in men, with substantial sex differences in risk factor strengths. In particular, a markedly stronger adverse effect of smoking in women may motivate targeted public health initiatives.
|
|
