| 1. |
- Blomberg, Anders, 1956, et al.
(författare)
-
Establishing the barnacle Balanus improvisus as a potent invertebrate monitoring system in marine ecotoxicogenomics
- 2009
-
Ingår i: SETAC Europe 19th Annual Meeting Abstract Book, Göteborg 31 May - 4 June, 2009.
-
Konferensbidrag (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- There is a need for potent invertebrate systems for assessing the impacts of environmental contaminants on marine ecosystems. Balanus improvisus, a marine athropod, has a number of promising characteristics that make it a good candidate in such efforts. We have conducted sequencing of a cDNA library from the cyprid larval stage and identified several detoxification systems as well as novel B. improvisus specific genes. To investigate the toxicological gene expression response in this organism, we performed a short-term exposure experiment of the cyprid larvae to two different biofouling substances. From a natural population of B. improvisus, 300 - 1000 cyprids were treated for 23 hours with 390nM CuO or with two different concentrations (10nM or 10μM) of meditomidine. Protein expression changes were studied by 2D-PAGE analysis after DIGE labelling. For gene expression analysis by DNA miroarrays total RNA was extracted and used for cDNA and cRNA/aRNA templates. Roughly 2000 B. improvisus genes were studied represented by 3000 different probes on the arrays (each in duplicates). Candidate genes were confirmed by qPCR. A number of protein expression changes were detected on the 2D gels as a result of the different treatments. Interestingly, the response to the different treatments clearly formed distinct groups in principle component analysis. The DNA microarray analysis revealed several genes as toxicity indicators, e.g. various heat shock proteins, some proteases and factors involved in regulatory processes (transcription factors). Our data indicate that B. improvisus may serve as a tool to evaluate the impacts of marine pollution, and thus to fill the niche as an important invertebrate marine model organism for ecotoxicology and environmental genomics.
|
|
| 2. |
- Pettersson, Ulrika, et al.
(författare)
-
Improved radial basis function methods for multi-dimensional option pricing
- 2006
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- In this paper, we have derived a radial basis function (RBF) based method for the pricing of financial contracts by solving the Black-Scholes partial differential equation. As an example of a financial contract that can be priced with this method we have chosen the multi-dimensional European basket call option. We have shown numerically that our scheme is second order accurate in time and spectrally accurate in space for constant shape parameter. For other, non-optimal choices of shape parameter values, the resulting convergence rate is algebraic. We propose an adaptive node point placement that improves the accuracy compared with a uniform distribution. Compared with an adaptive finite difference method, the RBF method is 20-40 times faster in one and two space dimensions and has approximately the same memory requirements.
|
|
| 3. |
|
|
| 4. |
- Pettersson, Ulrika, et al.
(författare)
-
Option pricing using radial basis functions
- 2005
-
Ingår i: Proc. ECCOMAS Thematic Conference on Meshless Methods. - Lisboa, Portugal : Departamento de Matemática, Instituto Superior Técnico. - 9729928916 ; , s. C24.1-6
-
Konferensbidrag (refereegranskat)
|
|
| 5. |
- Benedict, Christian, et al.
(författare)
-
Acute sleep deprivation increases serum levels of neuron-specific enolase (NSE) and S100 calcium binding protein B (S-100B) in healthy young men.
- 2014
-
Ingår i: Sleep. - : Oxford University Press (OUP). - 1550-9109 .- 0161-8105. ; 37:1, s. 195-8
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- To investigate whether total sleep deprivation (TSD) affects circulating concentrations of neuron-specific enolase (NSE) and S100 calcium binding protein B (S-100B) in humans. These factors are usually found in the cytoplasm of neurons and glia cells. Increasing concentrations of these factors in blood may be therefore indicative for either neuronal damage, impaired blood brain barrier function, or both. In addition, amyloid β (Aβ) peptides 1-42 and 1-40 were measured in plasma to calculate their ratio. A reduced plasma ratio of Aβ peptides 1-42 to 1-40 is considered an indirect measure of increased deposition of Aβ 1-42 peptide in the brain.
|
|
| 6. |
- Conaway, H Herschel, et al.
(författare)
-
Retinoids stimulate periosteal bone resorption by enhancing the protein RANKL, a response inhibited by monomeric glucocorticoid receptor.
- 2011
-
Ingår i: The Journal of biological chemistry. - 1083-351X .- 0021-9258. ; 286:36, s. 31425-36
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Increased vitamin A (retinol) intake has been suggested to increase bone fragility. In the present study, we investigated effects of retinoids on bone resorption in cultured neonatal mouse calvarial bones and their interaction with glucocorticoids (GC). All-trans-retinoic acid (ATRA), retinol, retinalaldehyde, and 9-cis-retinoic acid stimulated release of (45)Ca from calvarial bones. The resorptive effect of ATRA was characterized by mRNA expression of genes associated with osteoclast differentiation, enhanced osteoclast number, and bone matrix degradation. In addition, the RANKL/OPG ratio was increased by ATRA, release of (45)Ca stimulated by ATRA was blocked by exogenous OPG, and mRNA expression of genes associated with bone formation was decreased by ATRA. All retinoid acid receptors (RARα/β/γ) were expressed in calvarial bones. Agonists with affinity to all receptor subtypes or specifically to RARα enhanced the release of (45)Ca and mRNA expression of Rankl, whereas agonists with affinity to RARβ/γ or RARγ had no effects. Stimulation of Rankl mRNA by ATRA was competitively inhibited by the RARα antagonist GR110. Exposure of calvarial bones to GC inhibited the stimulatory effects of ATRA on (45)Ca release and Rankl mRNA and protein expression. This inhibitory effect was reversed by the glucocorticoid receptor (GR) antagonist RU 486. Increased Rankl mRNA stimulated by ATRA was also blocked by GC in calvarial bones from mice with a GR mutation that blocks dimerization (GR(dim) mice). The data suggest that ATRA enhances periosteal bone resorption by increasing the RANKL/OPG ratio via RARα receptors, a response that can be inhibited by monomeric GR.
|
|
| 7. |
- Florin, Ulrika, 1964-
(författare)
-
Från idé till gestaltningsförslag : fallstudie från Projekt Konstpaus
- 2010
-
Licentiatavhandling (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Populär sammanfattning I vårt samhälle finns många offentliga konstverk. Dessa verk har kommit till på olika sätt men gemensamt är att konstverken i de allra flesta fall upphandlats med utgångspunkt i någon form av skiss. Skissen föregår det kommande konstverket och tjänar som underlag för beslut om upphandling av verket i full skala. Kunskapen om hur skisser kan tydas varierar och dessutom förekommer flera typer av skisser som var för sig fordrar olika sorters insikter av betraktaren (beslutsfattaren) för att kunna tolkas. Det övergripande temat för avhandlingen är kommunikationsprocesserna i relation till utvecklingen av 12 konstnärers gestaltningsförslag, tävlingsbidrag, samt hur juryns bedömning av dessa ser ut. Studien är baserad på material insamlat från de deltagande konstnärernas processer i Projekt Konstpaus, ett projekt delfinansierat av EU. Syftet med studien är att öka förståelsen för hur konstnärer utformar sina gestaltningsförslag, samt hur dessa förslag används och värderas. För att göra detta har tävlingsbidragen analyserats och konstnärerna intervjuats. Konstnärliga gestaltningsprocesser har synliggjorts liksom kommunikationen mellan beställare och konstnär.Bland annat har det framkommit att det finns en större potential att förmedla ett komplext gestaltningsinnehåll till en jury med stöd av digitala skisser, än vid användande av traditionella skisser. Det har visat sig att det kommande konstverkets kvaliteter blir synliga, men också att de brister som finns i gestaltningen tydliggörs i 3D- skisserna. Liksom teknologier tidigare i historien haft sin påverkan på bildutvecklingen, tolkningen och seendet har också övergången till digitala skisstekniker denna inverkan. Det har också visat sig att den text som tillhör respektive tävlingsbidrag haft avgörande betydelse för utfallet av jurybedömningen. Muntliga och skriftliga presentationer, bilagor och brev har påverkat juryn i sina beslut.Studien har också visat hur konstnärer kan tolka och förmedla resultat av en inventering och genom sina skisser förmedla dessa tolkningar. Konsten som tolkare av miljö, tid och tanke, kan gestalta information om en plats och i och med detta också fungera värnande för ett samhälles identitet i olika faser av en utveckling.Studien har bidragit med en djupare inblick i konstnärliga gestaltningsprocesser och hur de kan beskrivas samt i och med detta också en fördjupad förståelse i allmänhet av kreativa processer.
|
|
| 8. |
- Mustamäki, Noora, et al.
(författare)
-
Fjällbacka, Västerhavet, 1989–2019; Torhamn, södra Egentliga Östersjön, 2002–2019; Kvädöfjärden, Egentliga Östersjön, 1981–2019; Holmöarna, Bottniska viken, 1989–2019
- 2020
-
Ingår i: Faktablad från integrerad kustfiskövervakning.
-
Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Inom den nationella miljöövervakningen av kust och hav bedrivs årligen sedan slutet av 1980-talet ett program för integrerad kustfiskövervakning i fyra nationella referensområden, ett vardera i Bottniska viken, Egentliga Östersjön, södra Egentliga Östersjön och Västerhavet. Syftet med programmet är att kartlägga fiskbeståndens status samt fiskens hälsotillstånd och miljögiftsbelastning för att upptäcka förändringar som indikerar storskalig påverkan av miljöhot som eutrofiering, miljögifter, klimatförändringar och andra miljöfaktorer. Detta faktablad sammanfattar resultaten från den integrerade kustfiskövervakningen i alla fyra områden under tidsperioden 1980–2019.
|
|
| 9. |
|
|
| 10. |
- Oei, Ling, et al.
(författare)
-
A genome-wide copy number association study of osteoporotic fractures points to the 6p25.1 locus
- 2014
-
Ingår i: Journal of Medical Genetics. - : BMJ Publishing Group. - 0022-2593 .- 1468-6244. ; 51:2, s. 122-131
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- BACKGROUND: Osteoporosis is a systemic skeletal disease characterised by reduced bone mineral density and increased susceptibility to fracture; these traits are highly heritable. Both common and rare copy number variants (CNVs) potentially affect the function of genes and may influence disease risk.AIM: To identify CNVs associated with osteoporotic bone fracture risk.METHOD: We performed a genome-wide CNV association study in 5178 individuals from a prospective cohort in the Netherlands, including 809 osteoporotic fracture cases, and performed in silico lookups and de novo genotyping to replicate in several independent studies.RESULTS: A rare (population prevalence 0.14%, 95% CI 0.03% to 0.24%) 210 kb deletion located on chromosome 6p25.1 was associated with the risk of fracture (OR 32.58, 95% CI 3.95 to 1488.89; p=8.69×10(-5)). We performed an in silico meta-analysis in four studies with CNV microarray data and the association with fracture risk was replicated (OR 3.11, 95% CI 1.01 to 8.22; p=0.02). The prevalence of this deletion showed geographic diversity, being absent in additional samples from Australia, Canada, Poland, Iceland, Denmark, and Sweden, but present in the Netherlands (0.34%), Spain (0.33%), USA (0.23%), England (0.15%), Scotland (0.10%), and Ireland (0.06%), with insufficient evidence for association with fracture risk.CONCLUSIONS: These results suggest that deletions in the 6p25.1 locus may predispose to higher risk of fracture in a subset of populations of European origin; larger and geographically restricted studies will be needed to confirm this regional association. This is a first step towards the evaluation of the role of rare CNVs in osteoporosis.
|
|
