Tyck till om SwePub Sök här!
WFRF:(Zamora MP)
Sökning: WFRF:(Zamora MP) > Naturvetenskap > Nuclear ribosomal i...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi
- Schoch, CL (författare)
- Seifert, KA (författare)
- Huhndorf, S (författare)
- visa fler...
- Robert, Vincent (författare)
- Spouge, JL (författare)
- Levesque, CA (författare)
- Chen, W (författare)
- Bolchacova, E (författare)
- Voigt, K (författare)
- Crous, PW (författare)
- Miller, AN (författare)
- Wingfield, MJ (författare)
- Aime, MC (författare)
- An, KD (författare)
- Bai, FY (författare)
- Barreto, RW (författare)
- Begerow, D (författare)
- Bergeron, MJ (författare)
- Blackwell, M (författare)
- Boekhout, T (författare)
- Bogale, M (författare)
- Boonyuen, N (författare)
- Burgaz, AR (författare)
- Buyck, B (författare)
- Cai, L (författare)
- Cai, Q (författare)
- Cardinali, G (författare)
- Chaverri, P (författare)
- Coppins, BJ (författare)
- Crespo, A (författare)
- Cubas, P (författare)
- Cummings, C (författare)
- Damm, U (författare)
- de Beer, ZW (författare)
- de Hoog, GS (författare)
- Del-Prado, R (författare)
- Dentinger, B (författare)
- Diéguez-Uribeondo, J (författare)
- Divakar, PK (författare)
- Douglas, B (författare)
- Dueñas, M (författare)
- Duong, TA (författare)
- Eberhardt, U (författare)
- Edwards, JE (författare)
- Elshahed, MS (författare)
- Fliegerova, K (författare)
- Furtado, M (författare)
- García, M (författare)
- Ge, ZW (författare)
- Griffith, GW (författare)
- Griffiths, K (författare)
- Groenewald, JZ (författare)
- Groenewald, M (författare)
- Grube, M (författare)
- Gryzenhout, M (författare)
- Guo, LD (författare)
- Hagen, F (författare)
- Hambleton, S (författare)
- Hamelin, RC (författare)
- Hansen, K (författare)
- Harrold, P (författare)
- Heller, G (författare)
- Herrera, C (författare)
- Hirayama, K (författare)
- Hirooka, Y (författare)
- Ho, HM (författare)
- Hoffmann, K (författare)
- Hofstetter, V (författare)
- Högnabba, F (författare)
- Hollingsworth, PM (författare)
- Hong, SB (författare)
- Hosaka, K (författare)
- Houbraken, J (författare)
- Hughes, K (författare)
- Huhtinen, S (författare)
- Hyde, KD (författare)
- James, T (författare)
- Johnson, EM (författare)
- Johnson, JE (författare)
- Johnston, PR (författare)
- Jones, EB (författare)
- Kelly, LJ (författare)
- Kirk, PM (författare)
- Knapp, DG (författare)
- Kõljalg, U (författare)
- Kovács, GM (författare)
- Kurtzman, CP (författare)
- Landvik, S (författare)
- Leavitt, SD (författare)
- Liggenstoffer, AS (författare)
- Liimatainen, K (författare)
- Lombard, L (författare)
- Luangsa-Ard, JJ (författare)
- Lumbsch, HT (författare)
- Maganti, H (författare)
- Maharachchikumbura, SS (författare)
- Martin, MP (författare)
- May, TW (författare)
- McTaggart, AR (författare)
- Methven, AS (författare)
- Meyer, W (författare)
- Moncalvo, J-M (författare)
- Mongkolsamrit, S (författare)
- Nagy, LG (författare)
- Niskanen, T (författare)
- Nyilasi, I (författare)
- Okada, G (författare)
- Okane, I (författare)
- Olariaga, I (författare)
- Otte, J (författare)
- Papp, T (författare)
- Park, D (författare)
- Petkovits, T (författare)
- Pino-Bodas, R (författare)
- Quaedvlieg, W (författare)
- Raja, HA (författare)
- Redecker, D (författare)
- Rintoul, TL (författare)
- Ruibal, C (författare)
- Sarmiento-Ramírez, JM (författare)
- Schmitt, I (författare)
- Schüßler, A (författare)
- Shearer, C (författare)
- Sotome, K (författare)
- Stefani, FO (författare)
- Stenroos, S (författare)
- Stielow, B (författare)
- Stockinger, H (författare)
- Suetrong, S (författare)
- Suh, SO (författare)
- Sung, GH (författare)
- Suzuki, M (författare)
- Tanaka, K (författare)
- Tedersoo, L (författare)
- Telleria, MT (författare)
- Tretter, E (författare)
- Untereiner, WA (författare)
- Urbina, H (författare)
- Vágvölgyi, C (författare)
- Vialle, A (författare)
- Vu, TD (författare)
- Walther, G (författare)
- Wang, QM (författare)
- Wang, Y (författare)
- Weir, BS (författare)
- Weiß, M (författare)
- White, MM (författare)
- Xu, J (författare)
- Yahr, R (författare)
- Yang, ZL (författare)
- Yurkov, A (författare)
- Zamora, JC (författare)
- Zhang, N (författare)
- Zhuang, WY (författare)
- Schindel, D (författare)
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2012-03-27
- 2012
- Engelska.
- Ingår i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - : Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1091-6490. ; 109:16, s. 6241-6246
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Six DNA regions were evaluated as potential DNA barcodes for Fungi, the second largest kingdom of eukaryotic life, by a multinational, multilaboratory consortium. The region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 used as the animal barcode was excluded as a potential marker, because it is difficult to amplify in fungi, often includes large introns, and can be insufficiently variable. Three subunits from the nuclear ribosomal RNA cistron were compared together with regions of three representative protein-coding genes (largest subunit of RNA polymerase II, second largest subunit of RNA polymerase II, and minichromosome maintenance protein). Although the protein-coding gene regions often had a higher percent of correct identification compared with ribosomal markers, low PCR amplification and sequencing success eliminated them as candidates for a universal fungal barcode. Among the regions of the ribosomal cistron, the internal transcribed spacer (ITS) region has the highest probability of successful identification for the broadest range of fungi, with the most clearly defined barcode gap between inter- and intraspecific variation. The nuclear ribosomal large subunit, a popular phylogenetic marker in certain groups, had superior species resolution in some taxonomic groups, such as the early diverging lineages and the ascomycete yeasts, but was otherwise slightly inferior to the ITS. The nuclear ribosomal small subunit has poor species-level resolution in fungi. ITS will be formally proposed for adoption as the primary fungal barcode marker to the Consortium for the Barcode of Life, with the possibility that supplementary barcodes may be developed for particular narrowly circumscribed taxonomic groups.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biologisk systematik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biological Systematics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Zoologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Zoology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
Nyckelord
- Fungi ; barcoding ; ITS
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Schoch, CL
- Seifert, KA
- Huhndorf, S
- Robert, Vincent
- Spouge, JL
- Levesque, CA
- visa fler...
- Chen, W
- Bolchacova, E
- Voigt, K
- Crous, PW
- Miller, AN
- Wingfield, MJ
- Aime, MC
- An, KD
- Bai, FY
- Barreto, RW
- Begerow, D
- Bergeron, MJ
- Blackwell, M
- Boekhout, T
- Bogale, M
- Boonyuen, N
- Burgaz, AR
- Buyck, B
- Cai, L
- Cai, Q
- Cardinali, G
- Chaverri, P
- Coppins, BJ
- Crespo, A
- Cubas, P
- Cummings, C
- Damm, U
- de Beer, ZW
- de Hoog, GS
- Del-Prado, R
- Dentinger, B
- Diéguez-Uribeond ...
- Divakar, PK
- Douglas, B
- Dueñas, M
- Duong, TA
- Eberhardt, U
- Edwards, JE
- Elshahed, MS
- Fliegerova, K
- Furtado, M
- García, M
- Ge, ZW
- Griffith, GW
- Griffiths, K
- Groenewald, JZ
- Groenewald, M
- Grube, M
- Gryzenhout, M
- Guo, LD
- Hagen, F
- Hambleton, S
- Hamelin, RC
- Hansen, K
- Harrold, P
- Heller, G
- Herrera, C
- Hirayama, K
- Hirooka, Y
- Ho, HM
- Hoffmann, K
- Hofstetter, V
- Högnabba, F
- Hollingsworth, P ...
- Hong, SB
- Hosaka, K
- Houbraken, J
- Hughes, K
- Huhtinen, S
- Hyde, KD
- James, T
- Johnson, EM
- Johnson, JE
- Johnston, PR
- Jones, EB
- Kelly, LJ
- Kirk, PM
- Knapp, DG
- Kõljalg, U
- Kovács, GM
- Kurtzman, CP
- Landvik, S
- Leavitt, SD
- Liggenstoffer, A ...
- Liimatainen, K
- Lombard, L
- Luangsa-Ard, JJ
- Lumbsch, HT
- Maganti, H
- Maharachchikumbu ...
- Martin, MP
- May, TW
- McTaggart, AR
- Methven, AS
- Meyer, W
- Moncalvo, J-M
- Mongkolsamrit, S
- Nagy, LG
- Nilsson, R. Henr ...
- Niskanen, T
- Nyilasi, I
- Okada, G
- Okane, I
- Olariaga, I
- Otte, J
- Papp, T
- Park, D
- Petkovits, T
- Pino-Bodas, R
- Quaedvlieg, W
- Raja, HA
- Redecker, D
- Rintoul, TL
- Ruibal, C
- Sarmiento-Ramíre ...
- Schmitt, I
- Schüßler, A
- Shearer, C
- Sotome, K
- Stefani, FO
- Stenroos, S
- Stielow, B
- Stockinger, H
- Suetrong, S
- Suh, SO
- Sung, GH
- Suzuki, M
- Tanaka, K
- Tedersoo, L
- Telleria, MT
- Tretter, E
- Untereiner, WA
- Urbina, H
- Vágvölgyi, C
- Vialle, A
- Vu, TD
- Walther, G
- Wang, QM
- Wang, Y
- Weir, BS
- Weiß, M
- White, MM
- Xu, J
- Yahr, R
- Yang, ZL
- Yurkov, A
- Zamora, JC
- Zhang, N
- Zhuang, WY
- Schindel, D
- visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Mikrobiologi ino ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Biologisk system ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Bioinformatik oc ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Zoologi
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Mikrobiologi
- Artiklar i publikationen
- Proceedings of t ...
- Proceedings of t ...
- Av lärosätet
- Göteborgs universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
