Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:du-39016" >
Probabilistic infer...
Probabilistic inference of the genetic architecture underlying functional enrichment of complex traits
-
Patxot, Marion (författare)
-
Banos, Daniel Trejo (författare)
-
Kousathanas, Athanasios (författare)
-
visa fler...
-
Orliac, Etienne J. (författare)
-
Ojavee, Sven E. (författare)
-
Moser, Gerhard (författare)
-
Holloway, Alexander (författare)
-
Sidorenko, Julia (författare)
-
Kutalik, Zoltan (författare)
-
Magi, Reedik (författare)
-
Visscher, Peter M. (författare)
-
- Rönnegård, Lars (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Högskolan Dalarna,Statistik,Swedish University of Agricultural Science,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,Dalarna University
-
Robinson, Matthew R. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2021-11-30
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 12:1
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://du.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://www.nature.c...
-
https://pub.epsilon.... (primary) (Raw object) (free)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://res.slu.se/i...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We develop a Bayesian model (BayesRR-RC) that provides robust SNP-heritability estimation, an alternative to marker discovery, and accurate genomic prediction, taking 22 seconds per iteration to estimate 8.4 million SNP-effects and 78 SNP-heritability parameters in the UK Biobank. We find that only ≤10% of the genetic variation captured for height, body mass index, cardiovascular disease, and type 2 diabetes is attributable to proximal regulatory regions within 10kb upstream of genes, while 12-25% is attributed to coding regions, 32–44% to introns, and 22-28% to distal 10-500kb upstream regions. Up to 24% of all cis and coding regions of each chromosome are associated with each trait, with over 3,100 independent exonic and intronic regions and over 5,400 independent regulatory regions having ≥95% probability of contributing ≥0.001% to the genetic variance of these four traits. Our open-source software (GMRM) provides a scalable alternative to current approaches for biobank data.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Patxot, Marion
-
Banos, Daniel Tr ...
-
Kousathanas, Ath ...
-
Orliac, Etienne ...
-
Ojavee, Sven E.
-
Moser, Gerhard
-
visa fler...
-
Holloway, Alexan ...
-
Sidorenko, Julia
-
Kutalik, Zoltan
-
Magi, Reedik
-
Visscher, Peter ...
-
Rönnegård, Lars
-
Robinson, Matthe ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Högskolan Dalarna
-
Sveriges Lantbruksuniversitet