Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:his-23313" >
Regional transcript...
Regional transcriptomic profiling reveals immune system enrichment in nonfailing atria as well as all chambers of the failing human heart
-
- Sandstedt, Mikael, 1990 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
- Vukusic, Kristina, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
- Johansson, Markus (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics
-
visa fler...
-
- Jonsson, Marianne, 1962 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
- Magnusson, Rasmus, 1992- (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics
-
- Mattsson Hultén, Lillemor, 1951 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine
-
- Dellgren, Göran, 1961 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine
-
- Jeppsson, Anders, 1960 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine
-
- Lindahl, Anders, 1954 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
- Synnergren, Jane (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine
-
- Sandstedt, Joakim (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- American Physiological Society, 2023
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiology. - : American Physiological Society. - 0363-6135 .- 1522-1539. ; 325:6, s. H1430-H1445
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The different chambers of the human heart demonstrate regional physiological traits and may be differentially affected during pathologic remodeling, resulting in heart failure. Few previous studies have, however, characterized the different chambers at a transcriptomic level. We therefore conducted whole-tissue RNA sequencing and gene set enrichment analysis of biopsies collected from the four chambers of adult failing (n = 8) and nonfailing (n = 11) human hearts. Atria and ventricles demonstrated distinct transcriptional patterns. Compared to nonfailing ventricles, the transcriptional pattern of nonfailing atria was enriched for a large number of gene sets associated with cardiogenesis, the immune system and bone morphogenetic protein (BMP), transforming growth factor beta (TGF beta), MAPK/JNK and Wnt signaling. Differences between failing and nonfailing hearts were also determined. The transcriptional pattern of failing atria was distinct compared to that of nonfailing atria and enriched for gene sets associated with the innate and adaptive immune system, TGF beta/SMAD signaling, and changes in endothelial, smooth muscle cell and cardiomyocyte physiology. Failing ventricles were also enriched for gene sets associated with the immune system. Based on the transcriptomic patterns, upstream regulators associated with heart failure were identified. These included many immune response factors predicted to be similarly activated for all chambers of failing hearts. In summary, the heart chambers demonstrate distinct transcriptional patterns that differ between failing and nonfailing hearts. Immune system signaling may be a hallmark of all four heart chambers in failing hearts, and could constitute a novel therapeutic target.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Utvecklingsbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Developmental Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Kardiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cardiac and Cardiovascular Systems (hsv//eng)
Nyckelord
- Heart Failure
- Immune system
- Normal Heart
- Transcriptomics
- Upstream Regulators
- Bioinformatik
- Bioinformatics
- heart failure
- immune system
- normal heart
- transcriptomics
- upstream regulators
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Sandstedt, Mikae ...
-
Vukusic, Kristin ...
-
Johansson, Marku ...
-
Jonsson, Mariann ...
-
Magnusson, Rasmu ...
-
Mattsson Hultén, ...
-
visa fler...
-
Dellgren, Göran, ...
-
Jeppsson, Anders ...
-
Lindahl, Anders, ...
-
Synnergren, Jane
-
Sandstedt, Joaki ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Utvecklingsbiolo ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Kardiologi
- Artiklar i publikationen
-
American Journal ...
- Av lärosätet
-
Högskolan i Skövde
-
Göteborgs universitet