Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:kth-119454" >
Ultranet :
Ultranet : efficient solver for the sparse inverse covariance selection problem in gene network modeling
-
- Järvstråt, Linnea (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Johansson, Mikael (författare)
- KTH Royal Institute of Technology,KTH,Reglerteknik
-
- Gullberg, Urban (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
visa fler...
-
- Nilsson, Björn (författare)
- Broad Institute
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2012-12-24
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Bioinformatics. - : Oxford University Press (OUP). - 1367-4803 .- 1367-4811. ; 29:4, s. 511-512
- Relaterad länk:
-
https://academic.oup...
-
visa fler...
-
http://www.ncbi.nlm....
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Graphical Gaussian models (GGMs) are a promising approach to identify gene regulatory networks. Such models can be robustly inferred by solving the sparse inverse covariance selection (SICS) problem. With the high dimensionality of genomics data, fast methods capable of solving large instances of SICS are needed. We developed a novel network modeling tool, Ultranet, that solves the SICS problem with significantly improved efficiency. Ultranet combines a range of mathematical and programmatical techniques, exploits the structure of the SICS problem and enables computation of genome-scale GGMs without compromising analytic accuracy.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Hematologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Hematology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas