Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:kth-147955" >
Proteome-wide Epito...
Proteome-wide Epitope Mapping of Antibodies Using Ultra-dense Peptide Arrays
-
- Forsström, Bjorn (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Axnäs, Barbara Bislawska (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
Stengele, Klaus-Peter (författare)
-
visa fler...
-
Buehler, Jochen (författare)
-
Albert, Thomas J. (författare)
-
Richmond, Todd A. (författare)
-
- Hu, Francis Jingxin (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Nilsson, Peter (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Hudson, Elton Paul (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Rockberg, Johan (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Uhlén, Mathias (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2014
- 2014
- Engelska.
-
Ingår i: Molecular & Cellular Proteomics. - 1535-9476 .- 1535-9484. ; 13:6, s. 1585-1597
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Antibodies are of importance for the field of proteomics, both as reagents for imaging cells, tissues, and organs and as capturing agents for affinity enrichment in mass-spectrometry-based techniques. It is important to gain basic insights regarding the binding sites (epitopes) of antibodies and potential cross-reactivity to nontarget proteins. Knowledge about an antibody's linear epitopes is also useful in, for instance, developing assays involving the capture of peptides obtained from trypsin cleavage of samples prior to mass spectrometry analysis. Here, we describe, for the first time, the design and use of peptide arrays covering all human proteins for the analysis of antibody specificity, based on parallel in situ photolithic synthesis of a total of 2.1 million overlapping peptides. This has allowed analysis of on-and off-target binding of both monoclonal and polyclonal antibodies, complemented with precise mapping of epitopes based on full amino acid substitution scans. The analysis suggests that linear epitopes are relatively short, confined to five to seven residues, resulting in apparent off-target binding to peptides corresponding to a large number of unrelated human proteins. However, subsequent analysis using recombinant proteins suggests that these linear epitopes have a strict conformational component, thus giving us new insights regarding how antibodies bind to their antigens.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Forsström, Bjorn
-
Axnäs, Barbara B ...
-
Stengele, Klaus- ...
-
Buehler, Jochen
-
Albert, Thomas J ...
-
Richmond, Todd A ...
-
visa fler...
-
Hu, Francis Jing ...
-
Nilsson, Peter
-
Hudson, Elton Pa ...
-
Rockberg, Johan
-
Uhlén, Mathias
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular & Cell ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan