SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:kth-316127"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:kth-316127" > A human adipose tis...

A human adipose tissue cell-type transcriptome atlas

Norreen-Thorsen, Marthe (författare)
Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway.
Struck, Eike Christopher (författare)
Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway.
Oling, Sofia (författare)
Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway.
visa fler...
Zwahlen, Martin (författare)
KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Royal Inst Technol KTH, Dept Prot Sci, Sci Life Lab, S-17121 Stockholm, Sweden
von Feilitzen, Kalle (författare)
KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Royal Inst Technol KTH, Dept Prot Sci, Sci Life Lab, S-17121 Stockholm, Sweden
Odeberg, Jacob, Professor, 1963- (författare)
KTH,Cellulär och klinisk proteomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway.;Royal Inst Technol KTH, Dept Prot Sci, Sci Life Lab, S-17121 Stockholm, Sweden.;Univ Hosp North Norway UNN, N-9019 Tromso, Norway.;Karolinska Univ Hosp, Coagulat Unit, Dept Hematol, S-17176 Stockholm, Sweden
Lindskog, Cecilia (författare)
Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Pontén, Fredrik (författare)
Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Uhlén, Mathias (författare)
KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Royal Inst Technol KTH, Dept Prot Sci, Sci Life Lab, S-17121 Stockholm, Sweden
Dusart, Philip (författare)
KTH,Cellulär och klinisk proteomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway.;Royal Inst Technol KTH, Dept Prot Sci, Sci Life Lab, S-17121 Stockholm, Sweden.;Karolinska Inst, Clin Chem & Blood Coagulat Res, Dept Mol Med & Surg, S-17176 Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Karolinska Univ Lab, Clin Chem, S-17176 Stockholm, Sweden
Butler, Lynn M. (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cellulär och klinisk proteomik,Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway.;Royal Inst Technol KTH, Dept Prot Sci, Sci Life Lab, S-17121 Stockholm, Sweden.;Karolinska Inst, Clin Chem & Blood Coagulat Res, Dept Mol Med & Surg, S-17176 Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Karolinska Univ Lab, Clin Chem, S-17176 Stockholm, Sweden
visa färre...
Arctic Univ Norway, Translat Vasc Res, Dept Clin Med, N-9019 Tromso, Norway Systembiologi (creator_code:org_t)
Elsevier BV, 2022
2022
Engelska.
Ingår i: Cell Reports. - : Elsevier BV. - 2211-1247. ; 40:2
Relaterad länk:
https://doi.org/10.1...
visa fler...
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
http://kipublication...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The importance of defining cell-type-specific genes is well acknowledged. Technological advances facilitate high-resolution sequencing of single cells, but practical challenges remain. Adipose tissue is composed pri-marily of adipocytes, large buoyant cells requiring extensive, artefact-generating processing for separation and analysis. Thus, adipocyte data are frequently absent from single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data -sets, despite being the primary functional cell type. Here, we decipher cell-type-enriched transcriptomes from unfractionated human adipose tissue RNA-seq data. We profile all major constituent cell types, using 527 visceral adipose tissue (VAT) or 646 subcutaneous adipose tissue (SAT) samples, identifying over 2,300 cell-type-enriched transcripts. Sex-subset analysis uncovers a panel of male-only cell-type-enriched genes. By resolving expression profiles of genes differentially expressed between SAT and VAT, we identify mesothelial cells as the primary driver of this variation. This study provides an accessible method to profile cell-type-enriched transcriptomes using bulk RNA-seq, generating a roadmap for adipose tissue biology.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Cellbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy