Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:kth-336298" >
Systematic transcri...
Systematic transcriptional analysis of human cell lines for gene expression landscape and tumor representation
-
- Jin, Han (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
- Zhang, Cheng (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
- Zwahlen, Martin (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
visa fler...
-
- von Feilitzen, Kalle (författare)
- KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Karlsson, Max (författare)
- KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Shi, Mengnan (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
- Yuan, Meng (författare)
- KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Song, Xiya (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
- Li, Xiangyu (författare)
- KTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Yang, Hong (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
- Turkez, Hasan (författare)
- Department of Medical Biology, Faculty of Medicine, Atatürk University, Erzurum, Turkey
-
- Fagerberg, Linn (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi
-
- Uhlén, Mathias (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi,Department of Neuroscience, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden
-
- Mardinoglu, Adil (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systembiologi,Centre for Host-Microbiome Interactions, Faculty of Dentistry, Oral & Craniofacial Sciences, King’s College London, London, UK
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Springer Nature, 2023
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Nature. - 2041-1723. ; 14:1, s. 5417-
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Cell lines are valuable resources as model for human biology and translational medicine. It is thus important to explore the concordance between the expression in various cell lines vis-à-vis human native and disease tissues. In this study, we investigate the expression of all human protein-coding genes in more than 1,000 human cell lines representing 27 cancer types by a genome-wide transcriptomics analysis. The cell line gene expression is compared with the corresponding profiles in various tissues, organs, single-cell types and cancers. Here, we present the expression for each cell line and give guidance for the most appropriate cell line for a given experimental study. In addition, we explore the cancer-related pathway and cytokine activity of the cell lines to aid human biology studies and drug development projects. All data are presented in an open access cell line section of the Human Protein Atlas to facilitate the exploration of all human protein-coding genes across these cell lines.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Jin, Han
-
Zhang, Cheng
-
Zwahlen, Martin
-
von Feilitzen, K ...
-
Karlsson, Max
-
Shi, Mengnan
-
visa fler...
-
Yuan, Meng
-
Song, Xiya
-
Li, Xiangyu
-
Yang, Hong
-
Turkez, Hasan
-
Fagerberg, Linn
-
Uhlén, Mathias
-
Mardinoglu, Adil
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Karolinska Institutet