Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:kth-36416" >
An improved method ...
An improved method for detecting and delineating genomic regions with altered gene expression in cancer
-
- Nilsson, Björn (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Johansson, Mikael (författare)
- KTH,Reglerteknik
-
- Heyden, Anders (författare)
- Malmö högskola,Malmö University,Teknik och samhälle (TS)
-
visa fler...
-
Nelander, Sven (författare)
-
- Fioretos, Thoas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Springer Science and Business Media LLC, 2008
- 2008
- Engelska.
-
Ingår i: GENOME BIOL. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1474-760X .- 1465-6906 .- 1474-7596. ; 9:1, s. R13-
- Relaterad länk:
-
https://genomebiolog...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
https://doi.org/10.1...
-
http://genomebiology...
-
https://mau.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Genomic regions with altered gene expression are a characteristic feature of cancer cells. We present a novel method for identifying such regions in gene expression maps. This method is based on total variation minimization, a classical signal restoration technique. In systematic evaluations, we show that our method combines top-notch detection performance with an ability to delineate relevant regions without excessive over-segmentation, making it a significant advance over existing methods. Software (Rendersome) is provided.
Ämnesord
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Industriell bioteknik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Industrial Biotechnology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- Bioengineering
- Bioteknik
- bioinformatics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas