SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-106873"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-106873" > Integrated genomic ...

Integrated genomic and prospective clinical studies show the importance of modular pleiotropy for disease susceptibility, diagnosis and treatment

Gustafsson, Mika (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
Edström, Måns (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för inflammationsmedicin,Hälsouniversitetet,Clinical and Experimental Medicine, Faculty of Health Sciences, Division of Clinical Immunology, Unit of Autoimmunity and Immune Regulation, Linköping University, Linköping, Sweden
Gawel, Danuta (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
visa fler...
Nestor, Colm (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
Wang, Hui (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
Zhang, Huan (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
Barrenäs, Fredrik (författare)
Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
Tojo, James (författare)
Department of Clinical Neurosciences, Karolinska Institutet and Centrum for Molecular Medicine, Stockholm, Sweden
Kockum, Ingrid (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute, Sweden Centre Molecular Med, Sweden
Olsson, Tomas (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute, Sweden Centre Molecular Med, Sweden
Serra-Musach, Jordi (författare)
Cancer and Systems Biology Unit, Catalan Institute of Oncology, IDIBELL, L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain
Bonifaci, Nuria (författare)
Cancer and Systems Biology Unit, Catalan Institute of Oncology, IDIBELL, L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain
Angel Pujana, Miguel (författare)
Cancer and Systems Biology Unit, Catalan Institute of Oncology, IDIBELL, L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain
Ernerudh, Jan (författare)
Östergötlands Läns Landsting,Linköpings universitet,Avdelningen för inflammationsmedicin,Hälsouniversitetet,Klinisk immunologi och transfusionsmedicin,Clinical and Experimental Medicine, Faculty of Health Sciences, Division of Clinical Immunology, Unit of Autoimmunity and Immune Regulation, Linköping University, Linköping, Sweden
Benson, Mikael (författare)
Östergötlands Läns Landsting,Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,Allergicentrum US,Barn- och ungdomskliniken i Linköping,The Centre for Individualised Medicine, Department of Clinical and Experimental Medicine, Linköping University, Linköping, Sweden
visa färre...
 (creator_code:org_t)
BioMed Central, 2014
2014
Engelska.
Ingår i: Genome Medicine. - : BioMed Central. - 1756-994X. ; 6:17
Relaterad länk:
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
visa fler...
https://genomemedici...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
http://kipublication...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Background: Translational research typically aims to identify and functionally validate individual, disease-specific genes. However, reaching this aim is complicated by the involvement of thousands of genes in common diseases, and that many of those genes are pleiotropic, that is, shared by several diseases. Methods: We integrated genomic meta-analyses with prospective clinical studies to systematically investigate the pathogenic, diagnostic and therapeutic roles of pleiotropic genes. In a novel approach, we first used pathway analysis of all published genome-wide association studies (GWAS) to find a cell type common to many diseases. Results: The analysis showed over-representation of the T helper cell differentiation pathway, which is expressed in T cells. This led us to focus on expression profiling of CD4(+) T cells from highly diverse inflammatory and malignant diseases. We found that pleiotropic genes were highly interconnected and formed a pleiotropic module, which was enriched for inflammatory, metabolic and proliferative pathways. The general relevance of this module was supported by highly significant enrichment of genetic variants identified by all GWAS and cancer studies, as well as known diagnostic and therapeutic targets. Prospective clinical studies of multiple sclerosis and allergy showed the importance of both pleiotropic and disease specific modules for clinical stratification. Conclusions: In summary, this translational genomics study identified a pleiotropic module, which has key pathogenic, diagnostic and therapeutic roles.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Reumatologi och inflammation (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Rheumatology and Autoimmunity (hsv//eng)

Nyckelord

MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy