SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-125836"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-125836" > Genetic and epigene...

Genetic and epigenetic characterization of hypodiploid acute lymphoblastic leukemia

Safavi, Setareh (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
Olsson, Linda (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden; University of and Regional Labs, Sweden
Biloglav, Andrea (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
visa fler...
Veerla, Srinivas (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
Blendberg, Molly (författare)
Lund University, Sweden
Tayebwa, Johnbosco (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
Behrendtz, Mikael (författare)
Linköpings universitet,Medicinska fakulteten,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Region Östergötland, Barn- och ungdomskliniken i Linköping
Castor, Anders (författare)
Lund University,Lunds universitet,Pediatrik, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Paediatrics (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
Hansson, Markus (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
Johansson, Bertil (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden; University of and Regional Labs, Sweden
Paulsson, Kajsa (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University, Sweden
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2015-10-30
2015
Engelska.
Ingår i: Oncotarget. - : IMPACT JOURNALS LLC. - 1949-2553. ; 6:40, s. 42793-42802
Relaterad länk:
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
visa fler...
http://www.oncotarge...
http://www.ncbi.nlm....
http://dx.doi.org/10... (free)
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Purpose: To investigate the genetic and epigenetic landscape of hypodiploid (<45 chromosomes) acute lymphoblastic leukemia (ALL). Methods: Single nucleotide polymorphism array, whole exome sequencing, RNA sequencing, and methylation array analyses were performed on eleven hypodiploid ALL cases. Results: In line with previous studies, mutations in IKZF3 and FLT3 were detected in near-haploid (25-30 chromosomes) cases. Low hypodiploidy (31-39 chromosomes) was associated with somatic TP53 mutations. Notably, mutations of this gene were also found in 3/3 high hypodiploid (40-44 chromosomes) cases, suggesting that the mutational patterns are similar in low hypodiploid and high hypodiploid ALL. The high hypodiploid ALLs frequently displayed substantial cell-to-cell variability in chromosomal content, indicative of chromosomal instability; a rare phenomenon in ALL. Gene expression analysis showed that genes on heterodisomic chromosomes were more highly expressed in hypodiploid cases. Cases clustered according to hypodiploid subtype in the unsupervised methylation analyses, but there was no association between chromosomal copy number and methylation levels. A comparison between samples obtained at diagnosis and relapse showed that the relapse did not arise from the major diagnostic clone in 3/4 cases. Conclusion: Taken together, our data support the conclusion that near-haploid and low hypodiploid ALL are different with regard to mutational profiles and also suggest that ALL cases with high hypodiploidy may harbor chromosomal instability.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Hematologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Hematology (hsv//eng)

Nyckelord

acute lymphoblastic leukemia; hypodiploidy; next generation sequencing; chromosomal instability

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy