Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-167929" >
Genetic association...
Genetic association of gemcitabine/carboplatin-induced leukopenia and neutropenia in non-small cell lung cancer patients using whole-exome sequencing.
-
- Svedberg, Anna, 1988- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för läkemedelsforskning,Medicinska fakulteten,Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci, Div Drug Res, Clin Pharmacol, SE-58185 Linköping, Sweden.
-
- Björn, Niclas, 1990- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för läkemedelsforskning,Medicinska fakulteten,Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci, Div Drug Res, Clin Pharmacol, SE-58185 Linköping, Sweden.
-
- Sigurgeirsson, Benjamin (författare)
- KTH,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH),KTH Royal Institute of Technology, Sweden;University of Iceland, Iceland,KTH Royal Inst Technol, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, Dept Gene Technol, Sci Life Lab, Solna, Sweden.;Univ Iceland, Sch Engn & Nat Sci, Reykjavik, Iceland.
-
visa fler...
-
- Pradhananga, Sailendra (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,KTH Royal Institute of Technology, Sweden,KTH Royal Inst Technol, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, Dept Gene Technol, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Brandén, Eva (författare)
- Uppsala universitet,Centrum för klinisk forskning, Gävleborg,Gävle Cent Hosp, Dept Resp Med, Gävle, Sweden
-
- Koyi, Hirsh (författare)
- Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Centrum för klinisk forskning, Gävleborg,Gävle Cent Hosp, Dept Resp Med, Gävle, Sweden
-
- Lewensohn, Rolf (författare)
- Karolinska Institutet
-
- De Petris, Luigi (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Apellániz-Ruiz, María (författare)
- Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Spain,Spanish Natl Canc Res Ctr CNIO, Hereditary Endocrine Canc Grp, Madrid, Spain.
-
- Rodríguez-Antona, Cristina (författare)
- Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Spain,Spanish Natl Canc Res Ctr CNIO, Hereditary Endocrine Canc Grp, Madrid, Spain.
-
- Lundeberg, Joakim (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi,KTH Royal Institute of Technology, Sweden,KTH Royal Inst Technol, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, Dept Gene Technol, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Gréen, Henrik, 1975- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för läkemedelsforskning,Medicinska fakulteten,KTH Royal Institute of Technology, Sweden; National Board of Forensic Medicine, Sweden,Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci, Div Drug Res, Clin Pharmacol, SE-58185 Linköping, Sweden.;KTH Royal Inst Technol, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, Dept Gene Technol, Sci Life Lab, Solna, Sweden.;Natl Board Forens Med, Dept Forens Genet & Forens Toxicol, Linköping, Sweden.
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier, 2020
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Lung Cancer. - : Elsevier. - 0169-5002 .- 1872-8332. ; 147, s. 106-114
- Relaterad länk:
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
visa fler...
-
http://www.lungcance...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- OBJECTIVES: Gemcitabine/carboplatin treatment is known to cause severe adverse drug reactions which can lead to the need for reduction or cessation of chemotherapy. It would be beneficial to identify patients at risk of severe hematological toxicity in advance before treatment start. This study aims to identify genetic markers for gemcitabine/carboplatin-induced leukopenia and neutropenia in non-small cell lung cancer patients.MATERIAL AND METHODS: Whole-exome sequencing was performed on 215 patients. Association analysis was performed on single-nucleotide variants (SNVs) and genes, and the validation was based on an independent genome-wide association study (GWAS). Based on the association and validation analyses the genetic variants were then selected for and used in weighted genetic risk score (wGRS) prediction models for leukopenia and neutropenia.RESULTS: Association analysis identified 50 and 111 SNVs, and 12 and 20 genes, for leukopenia and neutropenia, respectively. Of these SNVS 20 and 19 were partially validated for leukopenia and neutropenia, respectively. The genes SVIL (p = 2.48E-06) and EFCAB2 (p = 4.63E-06) were significantly associated with leukopenia contain the partially validated SNVs rs3740003, rs10160013, rs1547169, rs10927386 and rs10927387. The wGRS prediction models showed significantly different risk scores for high and low toxicity patients.CONCLUSION: We have identified and partially validated genetic biomarkers in SNVs and genes correlated to gemcitabine/carboplatin-induced leukopenia and neutropenia and created wGRS models for predicting the risk of chemotherapy-induced hematological toxicity. These results provide a strong foundation for further studies of chemotherapy-induced toxicity.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Farmakologi och toxikologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Pharmacology and Toxicology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- Adverse drug reactions
- Carboplatin
- Chemotherapy
- Gemcitabine
- Hematological toxicity
- Non-small cell lung cancer
- Toxicity
- Whole-exome sequencing
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Svedberg, Anna, ...
-
Björn, Niclas, 1 ...
-
Sigurgeirsson, B ...
-
Pradhananga, Sai ...
-
Brandén, Eva
-
Koyi, Hirsh
-
visa fler...
-
Lewensohn, Rolf
-
De Petris, Luigi
-
Apellániz-Ruiz, ...
-
Rodríguez-Antona ...
-
Lundeberg, Joaki ...
-
Gréen, Henrik, 1 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Farmakologi och ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Lung Cancer
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet