Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-183530" >
A protocol for char...
A protocol for characterization of extremely preterm infant gut microbiota in double-blind clinical trials
-
- Generó, Magalí Martí, 1983- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten
-
- Spreckels, Johanne, 1992- (författare)
- Linköpings universitet,Medicinska fakulteten,Avdelningen för inflammation och infektion,Department of Genetics, University Medical Centre Groningen, Groningen, the Netherlands
-
- Jenmalm, Maria, 1971- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten
-
visa fler...
-
- Abrahamsson, Thomas, 1968- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Cambridge, MA, United States : Cell press, 2021
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: STAR Protocols. - Cambridge, MA, United States : Cell press. - 2666-1667. ; 2:3
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- 16S rRNA gene sequencing enables microbial community profiling, but recovering fecal DNA from extremely premature infants is challenging. Here, we describe an optimized protocol for fecal DNA isolation, library preparation for 16S rRNA gene sequencing, taxonomy assignation, and statistical analyses. The protocol is complemented with a quantitative PCR for probiotic L. reuteri identification. This protocol describes how to characterize preterm infant gut microbiota and relate it to probiotic supplementation and clinical outcomes. It is customizable for other clinical trials. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Martí et al. (2021) and Spreckels et al. (2021).
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
Nyckelord
- Clinical Protocol; Health Sciences; Microbiology; Molecular Biology; Sequencing
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas