Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:su-139313" >
A microarray whole-...
A microarray whole-genome gene expression dataset in a rat model of inflammatory corneal angiogenesis
-
- Mukwaya, Anthony (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för neuro- och inflammationsvetenskap,Medicinska fakulteten
-
- Lindvall, Jessica M. (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm University, Sweden
-
- Xeroudaki, Maria (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för neuro- och inflammationsvetenskap,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Ögonkliniken US
-
visa fler...
-
- Peebo, Beatrice (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för neuro- och inflammationsvetenskap,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Ögonkliniken US
-
- Ali, Zaheer (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten
-
- Lennikov, Anton (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för neuro- och inflammationsvetenskap,Medicinska fakulteten
-
- Jensen, Lasse (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Klinisk farmakologi,Karolinska Institute, Sweden
-
- Lagali, Neil (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för neuro- och inflammationsvetenskap,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Ögonkliniken US
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2016-11-22
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Data. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2052-4463. ; 3
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In angiogenesis with concurrent inflammation, many pathways are activated, some linked to VEGF and others largely VEGF-independent. Pathways involving inflammatory mediators, chemokines, and micro-RNAs may play important roles in maintaining a pro-angiogenic environment or mediating angiogenic regression. Here, we describe a gene expression dataset to facilitate exploration of pro-angiogenic, pro-inflammatory, and remodelling/normalization-associated genes during both an active capillary sprouting phase, and in the restoration of an avascular phenotype. The dataset was generated by microarray analysis of the whole transcriptome in a rat model of suture-induced inflammatory corneal neovascularisation. Regions of active capillary sprout growth or regression in the cornea were harvested and total RNA extracted from four biological replicates per group. High quality RNA was obtained for gene expression analysis using microarrays. Fold change of selected genes was validated by qPCR, and protein expression was evaluated by immunohistochemistry. We provide a gene expression dataset that may be re-used to investigate corneal neovascularisation, and may also have implications in other contexts of inflammation-mediated angiogenesis.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Geovetenskap och miljövetenskap -- Oceanografi, hydrologi och vattenresurser (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Earth and Related Environmental Sciences -- Oceanography, Hydrology and Water Resources (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas