Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:su-206825" >
Multi-omics insight...
Multi-omics insights into host-viral response and pathogenesis in Crimean-Congo hemorrhagic fever viruses for novel therapeutic target
-
- Neogi, Ujjwal (författare)
- Karolinska Institutet
-
Elaldi, Nazif (författare)
-
Appelberg, Sofia (författare)
-
visa fler...
-
- Ambikan, Anoop (författare)
- Karolinska Institutet
-
Kennedy, Emma (författare)
-
Dowall, Stuart (författare)
-
Bagci, Binnur K. (författare)
-
- Gupta, Soham (författare)
- Karolinska Institutet
-
Rodriguez, Jimmy E. (författare)
-
- Svensson-Akusjärvi, Sara (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Monteil, Vanessa (författare)
- Karolinska Institutet
-
Vegvari, Akos (författare)
-
- Benfeitas, Rui (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
Banerjea, Akhil (författare)
-
Weber, Friedemann (författare)
-
Hewson, Roger (författare)
-
Mirazimi, Ali (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: eLIFE. - 2050-084X. ; 11
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.7...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.7...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The pathogenesis and host-viral interactions of the Crimean–Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (CCHFV) are convoluted and not well evaluated. Application of the multi-omics system biology approaches, including biological network analysis in elucidating the complex host-viral response, interrogates the viral pathogenesis. The present study aimed to fingerprint the system-level alterations during acute CCHFV-infection and the cellular immune responses during productive CCHFV-replication in vitro. We used system-wide network-based system biology analysis of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from a longitudinal cohort of CCHF patients during the acute phase of infection and after one year of recovery (convalescent phase) followed by untargeted quantitative proteomics analysis of the most permissive CCHFV-infected Huh7 and SW13 cells. In the RNAseq analysis of the PBMCs, comparing the acute and convalescent-phase, we observed system-level host’s metabolic reprogramming towards central carbon and energy metabolism (CCEM) with distinct upregulation of oxidative phosphorylation (OXPHOS) during CCHFV-infection. Upon application of network-based system biology methods, negative coordination of the biological signaling systems like FOXO/Notch axis and Akt/mTOR/HIF-1 signaling with metabolic pathways during CCHFV-infection were observed. The temporal quantitative proteomics in Huh7 showed a dynamic change in the CCEM over time and concordant with the cross-sectional proteomics in SW13 cells. By blocking the two key CCEM pathways, glycolysis and glutaminolysis, viral replication was inhibited in vitro. Activation of key interferon stimulating genes during infection suggested the role of type I and II interferon-mediated antiviral mechanisms both at the system level and during progressive replication.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
eLIFE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Neogi, Ujjwal
-
Elaldi, Nazif
-
Appelberg, Sofia
-
Ambikan, Anoop
-
Kennedy, Emma
-
Dowall, Stuart
-
visa fler...
-
Bagci, Binnur K.
-
Gupta, Soham
-
Rodriguez, Jimmy ...
-
Svensson-Akusjär ...
-
Monteil, Vanessa
-
Vegvari, Akos
-
Benfeitas, Rui
-
Banerjea, Akhil
-
Weber, Friedeman ...
-
Hewson, Roger
-
Mirazimi, Ali
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Infektionsmedici ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
- Artiklar i publikationen
-
eLIFE
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Karolinska Institutet