Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:su-230222" >
KODFISH, a direct R...
KODFISH, a direct RNA targeted, single nucleotide sensitive in situ transcriptomics.
-
- lee, hower (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- shakari, nick (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- grillo, marco (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
visa fler...
-
- nilsson, mats (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Engelska.
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In-situ detection of expressed point mutations within fixed cells or tissues is challenging due to the low sensitivity or poor specificity of available molecular tools. Here, we present KODFISH, an efficient and specific approach based on single nucleotide sensitive RNA-based in-situ sequencing (RNA-ISS) using padlock probes and rolling circle amplification. KODFISH enables the accurate in-situ discrimination of single nucleotide changes, allowing the spatial detection of expressed mutations with higher sensitivity and specificity than currently available methods.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- in situ hybridization
- in situ sequencing
- spatial transcriptomics
- biokemi
- Biochemistry
Publikations- och innehållstyp
- vet (ämneskategori)
- ovr (ämneskategori)