Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:umu-164548" >
Computational and E...
Computational and Experimental Druggability Assessment of Human DNA Glycosylases
-
- Michel, Maurice (författare)
- Karolinska Institutet
-
Visnes, Torkild (författare)
-
- Homan, Evert J. (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa fler...
-
- Seashore-Ludlow, Brinton (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Hedenström, Mattias, 1976- (författare)
- Umeå universitet,Kemiska institutionen
-
- Wiita, Elisee (författare)
- Karolinska Institutet
-
Vallin, Karl (författare)
-
Paulin, Cynthia B. J. (författare)
-
Zhang, Jiaxi (författare)
-
- Wallner, Olov (författare)
- Karolinska Institutet
-
Scobie, Martin (författare)
-
Schmidt, Andreas (författare)
-
- Jenmalm-Jensen, Annika (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Berglund, Ulrika Warpman (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Helleday, Thomas (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-07-05
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: ACS Omega. - : American Chemical Society (ACS). - 2470-1343. ; 4:7, s. 11642-11656
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://umu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://pubs.acs.org...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Due to a polar or even charged binding interface, DNA-binding proteins are considered extraordinarily difficult targets for development of small-molecule ligands and only a handful of proteins have been targeted successfully to date. Recently, however, it has been shown that development of selective and efficient inhibitors of 8-oxoguanine DNA glycosylase is possible. Here, we describe the initial druggability assessment of DNA glycosylases in a computational setting and experimentally investigate several methods to target endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) with small-molecule inhibitors. We find that DNA glycosylases exhibit good predicted druggability in both DNA-bound and -unbound states. Furthermore, we find catalytic sites to be highly flexible, allowing for a range of interactions and binding partners. One flexible catalytic site was rationalized for NEIL1 and further investigated experimentally using both a biochemical assay in the presence of DNA and a thermal shift assay in the absence of DNA.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Michel, Maurice
-
Visnes, Torkild
-
Homan, Evert J.
-
Seashore-Ludlow, ...
-
Hedenström, Matt ...
-
Wiita, Elisee
-
visa fler...
-
Vallin, Karl
-
Paulin, Cynthia ...
-
Zhang, Jiaxi
-
Wallner, Olov
-
Scobie, Martin
-
Schmidt, Andreas
-
Jenmalm-Jensen, ...
-
Berglund, Ulrika ...
-
Helleday, Thomas
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
ACS Omega
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Karolinska Institutet