Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:umu-164896" >
A role for the Sacc...
A role for the Saccharomyces cerevisiae ABCF protein New1 in translation termination/recycling
-
- Kasari, Villu (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
-
Pochopien, Agnieszka A. (författare)
-
- Margus, Tonu (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
-
visa fler...
-
- Murina, Victoriia (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
-
- Turnbull, Kathryn Jane (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
-
- Zhou, Yang, 1986- (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)
-
- Nissan, Tracy (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,University of Sussex, UK
-
Graf, Michael (författare)
-
Novacek, Jiri (författare)
-
- Atkinson, Gemma C. (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)
-
- Johansson, Marcus J. O. (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)
-
Wilson, Daniel N. (författare)
-
- Hauryliuk, Vasili, 1980- (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS),University of Tartu, Institute of Technology, 50411 Tartu, Estonia
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-07-12
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Nucleic Acids Research. - : Oxford University Press. - 0305-1048 .- 1362-4962. ; 47:16, s. 8807-8820
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
https://umu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://academic.oup...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Translation is controlled by numerous accessory proteins and translation factors. In the yeast Saccharomyces cerevisiae, translation elongation requires an essential elongation factor, the ABCF ATPase eEF3. A closely related protein, New1, is encoded by a non-essential gene with cold sensitivity and ribosome assembly defect knock-out phenotypes. Since the exact molecular function of New1 is unknown, it is unclear if the ribosome assembly defect is direct, i.e. New1 is a bona fide assembly factor, or indirect, for instance due to a defect in protein synthesis. To investigate this, we employed yeast genetics, cryo-electron microscopy (cryo-EM) and ribosome profiling (Ribo-Seq) to interrogate the molecular function of New1. Overexpression of New1 rescues the inviability of a yeast strain lacking the otherwise strictly essential translation factor eEF3. The structure of the ATPase-deficient (EQ2) New1 mutant locked on the 80S ribosome reveals that New1 binds analogously to the ribosome as eEF3. Finally, Ribo-Seq analysis revealed that loss of New1 leads to ribosome queuing upstream of 3′-terminal lysine and arginine codons, including those genes encoding proteins of the cytoplasmic translational machinery. Our results suggest that New1 is a translation factor that fine-tunes the efficiency of translation termination or ribosome recycling.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Kasari, Villu
-
Pochopien, Agnie ...
-
Margus, Tonu
-
Murina, Victorii ...
-
Turnbull, Kathry ...
-
Zhou, Yang, 1986 ...
-
visa fler...
-
Nissan, Tracy
-
Graf, Michael
-
Novacek, Jiri
-
Atkinson, Gemma ...
-
Johansson, Marcu ...
-
Wilson, Daniel N ...
-
Hauryliuk, Vasil ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Nucleic Acids Re ...
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Stockholms universitet