Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:umu-45978" >
A candidate CpG SNP...
A candidate CpG SNP approach identifies a breast cancer associated ESR1-SNP
-
- Harlid, Sophia, 1978- (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups
-
Ivarsson, Malin I L (författare)
-
- Butt, Salma (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Kirurgi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Internmedicin - epidemiologi,Surgery,Lund University Research Groups,Internal Medicine - Epidemiology
-
visa fler...
-
Hussain, Shehnaz (författare)
-
Grzybowska, Ewa (författare)
-
Eyfjörd, Jorunn Erla (författare)
-
Lenner, Per (författare)
-
- Försti, Asta (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Hemminki, Kari (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups
-
- Manjer, Jonas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Kirurgi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Surgery,Lund University Research Groups
-
- Dillner, Joakim (författare)
- Karolinska Institutet,Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups
-
- Carlson, Joyce (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk kemi och farmakologi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Chemistry and Pharmacology,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2011-03-11
- 2011
- Engelska.
-
Ingår i: International Journal of Cancer. - : Wiley-Blackwell. - 0020-7136 .- 1097-0215. ; 129:7, s. 1689-1698
- Relaterad länk:
-
https://onlinelibrar...
-
visa fler...
-
http://www.ncbi.nlm....
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Altered DNA methylation is often seen in malignant cells, potentially contributing to carcinogenesis by suppressing gene expression. We hypothesized that heritable methylation potential might be a risk factor for breast cancer and evaluated possible association with breast cancer for single nucleotide polymorphisms (SNPs) either involving CpG sequences in extended 5'-regulatory regions of candidate genes (ESR1, ESR2, PGR, and SHBG) or CpG and missense coding SNPs in genes involved in methylation (MBD1, MECP2, DNMT1, MGMT, MTHFR, MTR, MTRR, MTHFD1, MTHFD2, BHMT, DCTD, and SLC19A1). Genome-wide searches for genetic risk factors for breast cancers have in general not investigated these SNPs, because of low minor allele frequency or weak haplotype associations. Genotyping was performed using Mass spectrometry-Maldi-Tof in a screening panel of 538 cases and 1,067 controls. Potential association to breast cancer was identified for 15 SNPs and one of these SNPs (rs7766585 in ESR1) was found to associate strongly with breast cancer, OR 1.30 (95% CI 1.17-1.45; p-value 2.1 × 10(-6) ), when tested in a verification panel consisting of 3,211 unique breast cancer cases and 4,223 unique controls from five European biobank cohorts. In conclusion, a candidate gene search strategy focusing on methylation-related SNPs did identify a SNP that associated with breast cancer at high significance.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- breast cancer
- methylation
- CpG SNPs
- ESR1
- Oncology
- Onkologi
- Oncology
- onkologi
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Harlid, Sophia, ...
-
Ivarsson, Malin ...
-
Butt, Salma
-
Hussain, Shehnaz
-
Grzybowska, Ewa
-
Eyfjörd, Jorunn ...
-
visa fler...
-
Lenner, Per
-
Försti, Asta
-
Hemminki, Kari
-
Manjer, Jonas
-
Dillner, Joakim
-
Carlson, Joyce
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
International Jo ...
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet