Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-13238" >
Efficient mapping o...
Efficient mapping of mendelian traits in dogs through genome-wide association
-
Karlsson, Elinor K. (författare)
-
Baranowska, Izabella (författare)
-
Wade, Claire M. (författare)
-
visa fler...
-
- Salmon Hillbertz, Nicolette H. C. (författare)
- Department of Animal Breeding and Genetics, Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden
-
Zody, Michael C. (författare)
-
Anderson, Nathan (författare)
-
Biagi, Tara M. (författare)
-
Patterson, Nick (författare)
-
- Pielberg, Gerli Rosengren (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
Kulbokas, Edward J. (författare)
-
Comstock, Kenine E. (författare)
-
Keller, Evan T. (författare)
-
Mesirov, Jill P. (författare)
-
von Euler, Henrik (författare)
-
- Kämpe, Olle (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Autoimmuna sjukdomar (Kämpe)
-
Hedhammar, Åke (författare)
-
Lander, Eric S. (författare)
-
Andersson, Göran (författare)
-
- Andersson, Leif (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Lindblad-Toh, Kerstin (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2007-09-30
- 2007
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Genetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1061-4036 .- 1546-1718. ; 39:11, s. 1321-1328
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- With several hundred genetic diseases and an advantageous genome structure, dogs are ideal for mapping genes that cause disease. Here we report the development of a genotyping array with |[sim]|27,000 SNPs and show that genome-wide association mapping of mendelian traits in dog breeds can be achieved with only |[sim]|20 dogs. Specifically, we map two traits with mendelian inheritance: the major white spotting (S) locus and the hair ridge in Rhodesian ridgebacks. For both traits, we map the loci to discrete regions of <1 Mb. Fine-mapping of the S locus in two breeds refines the localization to a region of |[sim]|100 kb contained within the pigmentation-related gene MITF. Complete sequencing of the white and solid haplotypes identifies candidate regulatory mutations in the melanocyte-specific promoter of MITF. Our results show that genome-wide association mapping within dog breeds, followed by fine-mapping across multiple breeds, will be highly efficient and generally applicable to trait mapping, providing insights into canine and human health.
Nyckelord
- MEDICINE
- MEDICIN
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Karlsson, Elinor ...
-
Baranowska, Izab ...
-
Wade, Claire M.
-
Salmon Hillbertz ...
-
Zody, Michael C.
-
Anderson, Nathan
-
visa fler...
-
Biagi, Tara M.
-
Patterson, Nick
-
Pielberg, Gerli ...
-
Kulbokas, Edward ...
-
Comstock, Kenine ...
-
Keller, Evan T.
-
Mesirov, Jill P.
-
von Euler, Henri ...
-
Kämpe, Olle
-
Hedhammar, Åke
-
Lander, Eric S.
-
Andersson, Göran
-
Andersson, Leif
-
Lindblad-Toh, Ke ...
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Genetics
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet