Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-231143" >
Chromosomal aneuplo...
Chromosomal aneuploidy affects the global proteome equilibrium of colorectal cancer cells
-
Gemoll, Timo (författare)
-
Habermann, Jens K. (författare)
-
Becker, Susanne (författare)
-
visa fler...
-
Szymczak, Silke (författare)
-
Upender, Madhvi B. (författare)
-
Bruch, Hans-Peter (författare)
-
- Hellman, Ulf (författare)
- Uppsala universitet,Ludwiginstitutet för cancerforskning
-
Ried, Thomas (författare)
-
Auer, Gert (författare)
-
Jornvall, Hans (författare)
-
Roblick, Uwe J. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Analytical Cellular Pathology. - 2210-7177 .- 2210-7185. ; 36:5-6, s. 149-161
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.3...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- BACKGROUND: Chromosomal aneuploidy has been identified as a prognostic factor in the majority of sporadic carcinomas. However, it is not known how chromosomal aneuploidy affects chromosome-specific protein expression in particular, and the cellular proteome equilibrium in general. OBJECTIVE: The aim was to detect chromosomal aneuploidy-associated expression changes in cell clones carrying trisomies found in colorectal cancer. METHODS: We used microcell-mediated chromosomal transfer to generate three artificial trisomic cell clones of the karyotypically stable, diploid, yet mismatch-deficient, colorectal cancer cell line DLD1 - each of them harboring one extra copy of either chromosome 3, 7 or 13. Protein expression differences were assessed by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry, compared to whole-genome gene expression data, and evaluated by PANTHER classification system and Ingenuity Pathway Analysis (IPA). RESULTS: In total, 79 differentially expressed proteins were identified between the trisomic clones and the parental cell line. Up-regulation of PCNA and HMGB I as well as down-regulation of IDH3A and PSMB3 were revealed as trisomy-associated alterations involved in regulating genome stability. CONCLUSIONS: These results show that trisomies affect the expression of genes and proteins that are not necessarily located on the trisomic chromosome, but reflect a pathway-related alteration of the cellular equilibrium.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- Aneuploidy
- genomic instability
- mass spectrometry
- pathway analysis
- two-dimensional gel-electrophoresis
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Gemoll, Timo
-
Habermann, Jens ...
-
Becker, Susanne
-
Szymczak, Silke
-
Upender, Madhvi ...
-
Bruch, Hans-Pete ...
-
visa fler...
-
Hellman, Ulf
-
Ried, Thomas
-
Auer, Gert
-
Jornvall, Hans
-
Roblick, Uwe J.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Analytical Cellu ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet