SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-315061"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-315061" > New computerized st...

New computerized staging method to analyze mink testicular tissue in environmental research

Fakhrzadeh, Azadeh (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Uppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Centrum för bildanalys,Centre for Image Analysis
Spörndly-Nees, Ellinor (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för anatomi, fysiologi och biokemi,Department of Anatomy, Physiology and Biochemistry (AFB)
Ekstedt, Elisabeth (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för anatomi, fysiologi och biokemi,Department of Anatomy, Physiology and Biochemistry (AFB)
visa fler...
Holm, Lena (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för anatomi, fysiologi och biokemi,Department of Anatomy, Physiology and Biochemistry (AFB)
Luengo Hendriks, Cris L. (författare)
Uppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,U
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
2016-08-12
2017
Engelska.
Ingår i: Environmental Toxicology and Chemistry. - : Wiley. - 0730-7268 .- 1552-8618. ; 36:1, s. 156-164
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Histopathology of testicular tissue is considered to be the most sensitive tool to detect adverse effects on male reproduction. When assessing tissue damage, seminiferous epithelium needs to be classified into different stages to detect certain cell damages; but stage identification is a demanding task. The authors present a method to identify the 12 stages in mink testicular tissue. The staging system uses Gata-4 immunohistochemistry to visualize acrosome development and proved to be both intraobserver-reproducible and interobserver-reproducible with a substantial agreement of 83.6% (kappa=0.81) and 70.5% (kappa=0.67), respectively. To further advance and objectify this method, they present a computerized staging system that identifies these 12 stages. This program has an agreement of 52.8% (kappa 0.47) with the consensus staging by 2 investigators. The authors propose a pooling of the stages into 5 groups based on morphology, stage transition, and toxicologically important endpoints. The computerized program then reached a substantial agreement of 76.7% (kappa=0.69). The computerized staging tool uses local ternary patterns to describe the texture of the tubules and a support vector machine classifier to learn which textures correspond to which stages. The results have the potential to modernize the tedious staging process required in toxicological evaluation of testicular tissue, especially if combined with whole-slide imaging and automated tubular segmentation. Environ Toxicol Chem 2017;36:156-164.

Ämnesord

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik -- Medicinsk bildbehandling (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering -- Medical Image Processing (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap -- Datavetenskap (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences -- Computer Sciences (hsv//eng)
LANTBRUKSVETENSKAPER  -- Veterinärmedicin -- Patobiologi (hsv//swe)
AGRICULTURAL SCIENCES  -- Veterinary Science -- Pathobiology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Geovetenskap och miljövetenskap -- Miljövetenskap (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Earth and Related Environmental Sciences -- Environmental Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

Male reproductive toxicology
Endocrine disruptor
Computational toxicology
Histopathology
Method

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy