id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-337112"
Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-337112" > Chromatin and Singl...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Chromatin and Single-Cell RNA- Seq Profiling Reveal Dynamic Signaling and Metabolic Transitions during Human Spermatogonial Stem Cell Development
-
- Guo, Jingtao (författare)
- Univ Utah, Sch Med, Dept Oncol Sci, Howard Hughes Med Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA.;Univ Utah, Sch Med, Huntsman Canc Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA.
-
- Grow, Edward J. (författare)
- Univ Utah, Sch Med, Dept Oncol Sci, Howard Hughes Med Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA.;Univ Utah, Sch Med, Huntsman Canc Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA.
-
- Yi, Chongil (författare)
- Univ Utah, Sch Med, Dept Oncol Sci, Howard Hughes Med Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA.;Univ Utah, Sch Med, Huntsman Canc Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA.
- visa fler...
- visa färre...
- Univ Utah, Sch Med, Dept Oncol Sci, Howard Hughes Med Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA;Univ Utah, Sch Med, Huntsman Canc Inst, Salt Lake City, UT 84112 USA. Univ Oxford, Radcliffe Dept Med, MRC Weatherall Inst Mol Med, Oxford OX3 9DS, England. (creator_code:org_t)
- CELL PRESS, 2017
- 2017
- Engelska.
- Ingår i: Cell Stem Cell. - : CELL PRESS. - 1934-5909 .- 1875-9777. ; 21:4, s. 533-546
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Human adult spermatogonial stem cells (hSSCs) must balance self-renewal and differentiation. To understand how this is achieved, we profiled DNA methylation and open chromatin (ATAC-seq) in SSEA4(+) hSSCs, analyzed bulk and single-cell RNA transcriptomes (RNA-seq) in SSEA4+ hSSCs and differentiating c-KIT+ spermatogonia, and performed validation studies via immunofluorescence. First, DNA hypomethylation at embryonic developmental genes supports their epigenetic "poising'' in hSSCs for future/embryonic expression, while core pluripotency genes (OCT4 and NANOG) were transcriptionally and epigenetically repressed. Interestingly, open chromatin in hSSCs was strikingly enriched in binding sites for pioneer factors (NFYA/B, DMRT1, and hormone receptors). Remarkably, single-cell RNA-seq clustering analysis identified four cellular/developmental states during hSSC differentiation, involving major transitions in cell-cycle and transcriptional regulators, splicing and signaling factors, and glucose/mitochondria regulators. Overall, our results outline the dynamic chromatin/transcription landscape operating in hSSCs and identify crucial molecular pathways that accompany the transition from quiescence to proliferation and differentiation.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Guo, Jingtao
- Grow, Edward J.
- Yi, Chongil
- Mlcochova, Hana
- Maher, Geoffrey ...
- Lindskog, Cecili ...
- visa fler...
- Murphy, Patrick ...
- Wike, Candice L.
- Carrell, Douglas ...
- Goriely, Anne
- Hotaling, James ...
- Cairns, Bradley ...
- visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
- Cell Stem Cell
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
