Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-364391" >
Single-cell RNA sequencing of mouse brain and lung vascular and vessel-associated cell types
-
- He, Liqun (författare)
- Tianjin Med Univ Gen Hosp, Key Lab Postneuroinjury Neurorepair & Regenerat C, Minist Educ & Tianjin City, Dept Neurosurg,Tianjin Neurol Inst, Tianjin 300052, Peoples R China
-
- Vanlandewijck, Michael, 1982- (författare)
- Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Vaskulärbiologi,Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Integrated Cardio Metab Ctr, Blickagangen 6, SE-14157 Huddinge, Sweden
-
- Mäe, Maarja Andaloussi (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
visa fler...
-
- Andrae, Johanna (författare)
- Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
-
- Ando, Koji (författare)
- Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
-
- Del Gaudio, Francesca (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Nahar, Khayrun (författare)
- Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
-
- Lebouvier, Thibaud (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Univ Lille, CHU, Memory Ctr, Inserm,U1171,Distalz, F-59000 Lille, France
-
- Lavina, Barbara (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Gouveia, Maria Leonor Seguardo (författare)
- Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
-
- Sun, Ying (författare)
- Zhongyuan Union Genet Technol Co Ltd, Dept Bioinformat, 45 9th East Rd, Tianjin 300304, Peoples R China
-
- Raschperger, Elisabeth (författare)
- Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Integrated Cardio Metab Ctr, Blickagangen 6, SE-14157 Huddinge, Sweden
-
- Segerstolpe, Asa (författare)
- Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Integrated Cardio Metab Ctr, Blickagangen 6, SE-14157 Huddinge, Sweden
-
- Liu, Jianping (författare)
- Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Integrated Cardio Metab Ctr, Blickagangen 6, SE-14157 Huddinge, Sweden
-
- Gustafsson, Sonja (författare)
- Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Integrated Cardio Metab Ctr, Blickagangen 6, SE-14157 Huddinge, Sweden
-
- Rasanen, Markus (författare)
- Univ Helsinki, Wihuri Res Inst, Haartmaninkatu 8,POB 63, FI-00014 Helsinki, Finland;Univ Helsinki, Translat Canc Biol Program, Biomedicum Helsinki, Haartmaninkatu 8,POB 63, FI-00014 Helsinki, Finland
-
- Zarb, Yvette (författare)
- Zurich Univ, Univ Zurich Hosp, Div Neurosurg, CH-8091 Zurich, Switzerland
-
- Mochizuki, Naoki (författare)
- Natl Cerebral & Cardiovasc Ctr, Dept Cell Biol, Res Inst, 5-7-1 Fujishirodai, Suita, Osaka 5658565, Japan;Natl Cerebral & Cardiovasc Ctr, AMED CREST, 5-7-1 Fujishirodai, Suita, Osaka 5658565, Japan
-
- Keller, Annika (författare)
- Zurich Univ, Univ Zurich Hosp, Div Neurosurg, CH-8091 Zurich, Switzerland
-
- Lendahl, Urban (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Betsholtz, Christer (författare)
- Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Vaskulärbiologi,Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Integrated Cardio Metab Ctr, Blickagangen 6, SE-14157 Huddinge, Sweden
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-08-21
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Data. - : NATURE PUBLISHING GROUP. - 2052-4463. ; 5
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://www.nature.c...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Vascular diseases are major causes of death, yet our understanding of the cellular constituents of blood vessels, including how differences in their gene expression profiles create diversity in vascular structure and function, is limited. In this paper, we describe a single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) dataset that defines vascular and vessel-associated cell types and subtypes in mouse brain and lung. The dataset contains 3,436 single cell transcriptomes from mouse brain, which formed 15 distinct clusters corresponding to cell (sub) types, and another 1,504 single cell transcriptomes from mouse lung, which formed 17 cell clusters. In order to allow user-friendly access to our data, we constructed a searchable database (http://betsholtzlab.org/VascularSingleCells/database.html). Our dataset constitutes a comprehensive molecular atlas of vascular and vessel-associated cell types in the mouse brain and lung, and as such provides a strong foundation for future studies of vascular development and diseases.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- Av författaren/redakt...
-
He, Liqun
-
Vanlandewijck, M ...
-
Mäe, Maarja Anda ...
-
Andrae, Johanna
-
Ando, Koji
-
Del Gaudio, Fran ...
-
visa fler...
-
Nahar, Khayrun
-
Lebouvier, Thiba ...
-
Lavina, Barbara
-
Gouveia, Maria L ...
-
Sun, Ying
-
Raschperger, Eli ...
-
Segerstolpe, Asa
-
Liu, Jianping
-
Gustafsson, Sonj ...
-
Rasanen, Markus
-
Zarb, Yvette
-
Mochizuki, Naoki
-
Keller, Annika
-
Lendahl, Urban
-
Betsholtz, Chris ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Data
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet