Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-424444" >
Overexpression of c...
Overexpression of chromatin remodeling and tyrosine kinase genes in iAMP21-positive acute lymphoblastic leukemia
-
- Ivanov Öfverholm, I. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Zachariadis, V. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Taylan, F. (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa fler...
-
- Marincevic-Zuniga, Yanara (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Tran, A. N. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Saft, L. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Nilsson, D. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Syvänen, Ann-Christine, 1950- (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Lönnerholm, G, 1941- (författare)
- Uppsala universitet,Barnneurologi/Barnonkologi
-
Harila-Saari, A. (författare)
-
- Nordenskjöld, M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Heyman, M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
Nordgren, A. (författare)
-
- Nordlund, Jessica (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Barbany, G. (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-10-22
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Leukemia and Lymphoma. - : Informa UK Limited. - 1042-8194 .- 1029-2403. ; 61:3, s. 604-613
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://www.tandfonl...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Intrachromosomal amplification of chromosome 21 (iAMP21) is a cytogenetic subtype associated with relapse and poor prognosis in pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP ALL). The biology behind the high relapse risk is unknown and the aim of this study was to further characterize the genomic and transcriptional landscape of iAMP21. Using DNA arrays and sequencing, we could identify rearrangements and aberrations characteristic for iAMP21. RNA sequencing revealed that only half of the genes in the minimal region of amplification (20/45) were differentially expressed in iAMP21. Among them were the top overexpressed genes (p < 0.001) in iAMP21 vs. BCP ALL without iAMP21 and three candidate genes could be identified, the tyrosine kinase gene DYRK1A and chromatin remodeling genes CHAF1B and SON. While overexpression of DYRK1A and CHAF1B is associated with poor prognosis in malignant diseases including myeloid leukemia, this is the first study to show significant correlation with iAMP21-positive ALL.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Hematologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Hematology (hsv//eng)
Nyckelord
- *Acute lymphoblastic leukemia
- *mp-wgs
- *gene expression analysis
- *iAMP21
- *transcriptome sequencing
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ivanov Öfverholm ...
-
Zachariadis, V.
-
Taylan, F.
-
Marincevic-Zunig ...
-
Tran, A. N.
-
Saft, L.
-
visa fler...
-
Nilsson, D.
-
Syvänen, Ann-Chr ...
-
Lönnerholm, G, 1 ...
-
Harila-Saari, A.
-
Nordenskjöld, M.
-
Heyman, M.
-
Nordgren, A.
-
Nordlund, Jessic ...
-
Barbany, G.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Hematologi
- Artiklar i publikationen
-
Leukemia and Lym ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet