onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-485905"
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-485905" > Approaches for cont...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Approaches for containerized scientific workflows in cloud environments with applications in life science
-
- Spjuth, Ola, Professor, 1977- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Capuccini, Marco (författare)
- Uppsala universitet,Avdelningen för beräkningsvetenskap,Tillämpad beräkningsvetenskap,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap
- Carone, Matteo (författare)
- visa fler...
- Stein, Oliver (författare)
- Ekmefjord, Morgan (författare)
- Tommaso, Paolo Di (författare)
- Floden, Evan (författare)
- Notredame, Cedric (författare)
- Moreno, Pablo (författare)
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2021-06-29
- 2021
- Engelska.
- Ingår i: F1000 Research. - : F1000 Research Ltd. - 2046-1402. ; 10, s. 513-513
- Tidskriftsartikel (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Containers are gaining popularity in life science research as they provide a solution for encompassing dependencies of provisioned tools, simplify software installations for end users and offer a form of isolation between processes. Scientific workflows are ideal for chaining containers into data analysis pipelines to aid in creating reproducible analyses. In this article, we review a number of approaches to using containers as implemented in the workflow tools Nextflow, Galaxy, Pachyderm, Argo, Kubeflow, Luigi and SciPipe, when deployed in cloud environments. A particular focus is placed on the workflow tool’s interaction with the Kubernetes container orchestration framework.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Bioinformatics
- Bioinformatik
Publikations- och innehållstyp
- vet (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Spjuth, Ola, Pro ...
- Capuccini, Marco
- Carone, Matteo
- Larsson, Anders
- Schaal, Wesley, ...
- Novella, Jon And ...
- visa fler...
- Stein, Oliver
- Ekmefjord, Morga ...
- Tommaso, Paolo D ...
- Floden, Evan
- Notredame, Cedri ...
- Moreno, Pablo
- Hellander, Andre ...
- Emami Khoonsari, ...
- Herman, Stephani ...
- Kultima, Kim
- Lampa, Samuel
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
- F1000 Research
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
