id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-486758"
Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-486758" > Identification of m...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Identification of motif-based interactions between SARS-CoV-2 protein domains and human peptide ligands pinpoint antiviral targets
-
- Mihalic, Filip (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Department of Medical Biochemistry and Microbiology, Uppsala University, Box 582, Husargatan 3, Uppsala, Sweden
-
- Benz, Caroline (författare)
- Uppsala universitet,Biokemi,Department of Chemistry - BMC, Uppsala University, Box 576, Husargatan 3, Uppsala, Sweden
-
- Kassa, Eszter (författare)
- Uppsala universitet,Biokemi,Department of Chemistry - BMC, Uppsala University, Box 576, Husargatan 3, Uppsala, Sweden
- visa fler...
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- Springer Nature, 2023
- 2023
- Engelska.
- Ingår i: Nature Communications. - : Springer Nature. - 2041-1723. ; 14:1
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The virus life cycle depends on host-virus protein-protein interactions, which often involve a disordered protein region binding to a folded protein domain. Here, we used proteomic peptide phage display (ProP-PD) to identify peptides from the intrinsically disordered regions of the human proteome that bind to folded protein domains encoded by the SARS-CoV-2 genome. Eleven folded domains of SARS-CoV-2 proteins were found to bind 281 peptides from human proteins, and affinities of 31 interactions involving eight SARS-CoV-2 protein domains were determined (KD ∼ 7-300 μM). Key specificity residues of the peptides were established for six of the interactions. Two of the peptides, binding Nsp9 and Nsp16, respectively, inhibited viral replication. Our findings demonstrate how high-throughput peptide binding screens simultaneously identify potential host-virus interactions and peptides with antiviral properties. Furthermore, the high number of low-affinity interactions suggest that overexpression of viral proteins during infection may perturb multiple cellular pathways.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- SARS-CoV-2
- large scale discovery
- phage display
- Short linear motifs
- Medical Biochemistry
- Medicinsk biokemi
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Mihalic, Filip
- Benz, Caroline
- Kassa, Eszter
- Lindquist, Richa ...
- Simonetti, Leand ...
- Inturi, Raviteja ...
- visa fler...
- Aronsson, Hanna
- Andersson, Eva
- Chi, Celestine N ...
- Davey, Norman E.
- Överby, Anna K.
- Jemth, Per
- Ivarsson, Ylva
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Klinisk medicin
- och Infektionsmedici ...
- Artiklar i publikationen
- Nature Communica ...
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
- Umeå universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
