Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-490599" >
Bayesian model and ...
Bayesian model and selection signature analyses reveal risk factors for canine atopic dermatitis
-
- Tengvall, Katarina, 1980- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Kerstin Lindblad-Toh
-
- Sundström, Elisabeth (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Wang, Chao (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa fler...
-
- Bergvall, Kerstin (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences
-
- Wallerman, Ola (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Pederson, Eric (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Karlsson, Åsa (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Harvey, Naomi D. (författare)
-
Blott, Sarah C. (författare)
-
Olby, Natasha (författare)
-
Olivry, Thierry (författare)
-
- Brander, Gustaf (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA
-
- Meadows, Jennifer R.S. (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Roosje, Petra (författare)
-
Leeb, Tosso (författare)
-
- Hedhammar, Åke (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences
-
- Andersson, Göran (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics
-
- Lindblad-Toh, Kerstin (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2022-12-08
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Communications Biology. - : Springer Nature. - 2399-3642. ; 5:1
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://pub.epsilon.... (primary) (Raw object) (free)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://res.slu.se/i...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Canine atopic dermatitis is an inflammatory skin disease with clinical similarities to human atopic dermatitis. Several dog breeds are at increased risk for developing this disease but previous genetic associations are poorly defined. To identify additional genetic risk factors for canine atopic dermatitis, we here apply a Bayesian mixture model adapted for mapping complex traits and a cross-population extended haplotype test to search for disease-associated loci and selective sweeps in four dog breeds at risk for atopic dermatitis. We define 15 associated loci and eight candidate regions under selection by comparing cases with controls. One associated locus is syntenic to the major genetic risk locus (Filaggrin locus) in human atopic dermatitis. One selection signal in common type Labrador retriever cases positions across the TBC1D1 gene (body weight) and one signal of selection in working type German shepherd controls overlaps the LRP1B gene (brain), near the KYNU gene (psoriasis). In conclusion, we identify candidate genes, including genes belonging to the same biological pathways across multiple loci, with potential relevance to the pathogenesis of canine atopic dermatitis. The results show genetic similarities between dog and human atopic dermatitis, and future across-species genetic comparisons are hereby further motivated.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- LANTBRUKSVETENSKAPER -- Veterinärmedicin -- Klinisk vetenskap (hsv//swe)
- AGRICULTURAL SCIENCES -- Veterinary Science -- Clinical Science (hsv//eng)
- LANTBRUKSVETENSKAPER -- Bioteknologi med applikationer på växter och djur -- Genetik och förädling inom lantbruksvetenskap (hsv//swe)
- AGRICULTURAL SCIENCES -- Agricultural Biotechnology -- Genetics and Breeding in Agricultural Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- Klinisk genetik
- Clinical Genetics
- Genetics
- Genetik
- Biologi
- Biology
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Tengvall, Katari ...
-
Sundström, Elisa ...
-
Wang, Chao
-
Bergvall, Kersti ...
-
Wallerman, Ola
-
Pederson, Eric
-
visa fler...
-
Karlsson, Åsa
-
Harvey, Naomi D.
-
Blott, Sarah C.
-
Olby, Natasha
-
Olivry, Thierry
-
Brander, Gustaf
-
Meadows, Jennife ...
-
Roosje, Petra
-
Leeb, Tosso
-
Hedhammar, Åke
-
Andersson, Göran
-
Lindblad-Toh, Ke ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Veterinärmedicin
-
och Klinisk vetenska ...
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Bioteknologi med ...
-
och Genetik och förä ...
- Artiklar i publikationen
-
Communications B ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Sveriges Lantbruksuniversitet