Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-498238" >
Using drug-induced ...
Using drug-induced cell states to build therapeutic combinations against nervous system cancers
-
- Larsson, Ida (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Popova, Gergana (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
Elgendy, Ramy (författare)
-
visa fler...
-
- Sundström, Anders (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Krona, Cecilia (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Jörnsten, Rebecka (författare)
- athematical Sciences, Chalmers University of Technology, Gothenburg
-
- Nelander, Sven (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Engelska.
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Evidence is amounting that nervous system cancers are heterogeneous at the single cell level, yet data are currently scarce on how therapeutic agents affect this heterogeneity. Here, we describe a new, data-driven strategy to identify drugs that modulate the intratumoral heterogeneity of nervous system cancers. First, we demonstrate that drugs elicit structured changes in pathway activation in patient-derived cells from glioblastomas, neuroblastomas and medulloblastomas. Second, we present a mathematical model to estimate how drugs induce changes in tumor heterogeneity, as defined by single cell RNA sequencing atlases of each disease. Finally, as an evaluation of our method we use it to identify candidate synergistic drug pairs based on the drugs' effects on intratumoral heterogeneity.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
Nyckelord
- Glioblastoma
- Neuroblastoma
- Medulloblastoma
- DRUG-Seq
- Oncology
- Onkologi
Publikations- och innehållstyp
- vet (ämneskategori)
- ovr (ämneskategori)