Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/144618" >
Defining cell popul...
Defining cell populations with single-cell gene expression profiling: correlations and identification of astrocyte subpopulations.
-
- Ståhlberg, Anders, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation,University of Gothenburg
-
- Andersson, Daniel, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation,University of Gothenburg
-
- Aurelius, Johan, 1980 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
visa fler...
-
- Faiz, Maryam (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation,University of Gothenburg
-
- Pekna, Marcela, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology,University of Gothenburg
-
Kubista, Mikael, 1961 (författare)
-
- Pekny, Milos, 1965 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation,University of Gothenburg
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2010-11-25
- 2011
- Engelska.
-
Ingår i: Nucleic acids research. - : Oxford University Press (OUP). - 1362-4962 .- 0305-1048. ; 39:4
- Relaterad länk:
-
https://academic.oup...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Single-cell gene expression levels show substantial variations among cells in seemingly homogenous populations. Astrocytes perform many control and regulatory functions in the central nervous system. In contrast to neurons, we have limited knowledge about functional diversity of astrocytes and its molecular basis. To study astrocyte heterogeneity and stem/progenitor cell properties of astrocytes, we used single-cell gene expression profiling in primary mouse astrocytes and dissociated mouse neurosphere cells. The transcript number variability for astrocytes showed lognormal features and revealed that cells in primary cultures to a large extent co-express markers of astrocytes and neural stem/progenitor cells. We show how subpopulations of cells can be identified at single-cell level using unsupervised algorithms and that gene correlations can be used to identify differences in activity of important transcriptional pathways. We identified two subpopulations of astrocytes with distinct gene expression profiles. One had an expression profile very similar to that of neurosphere cells, whereas the other showed characteristics of activated astrocytes in vivo.
Nyckelord
- Animals
- Astrocytes
- classification
- metabolism
- Cells
- Cultured
- Gene Expression
- Gene Expression Profiling
- methods
- Mice
- RNA
- Messenger
- analysis
- Single-Cell Analysis
- Stem Cells
- metabolism
- Up-Regulation
- Gene Expression Profiling
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ståhlberg, Ander ...
-
Andersson, Danie ...
-
Aurelius, Johan, ...
-
Faiz, Maryam
-
Pekna, Marcela, ...
-
Kubista, Mikael, ...
-
visa fler...
-
Pekny, Milos, 19 ...
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Nucleic acids re ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola