Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/191443" >
DNA Methylation Cha...
DNA Methylation Changes Separate Allergic Patients from Healthy Controls and May Reflect Altered CD4⁺ T-Cell Population Structure
-
- Nestor, Colm (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
- Barrenäs, Fredrik, 1981 (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
- Wang, Hui (författare)
- Linköpings universitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik,Institute of Clinical Sciences, Department of Pediatrics,University of Gothenburg,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
visa fler...
-
- Lentini, Antonio (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
- Zhang, Huan (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
- Bruhn, Sören (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
- Jörnsten, Rebecka, 1971 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg, Sweden
-
- Langston, M.A. (författare)
- University of Tennessee,University of Tennessee, TN USA
-
- Rogers, G. (författare)
- University of Tennessee,University of Tennessee, TN USA
-
- Gustafsson, Mika (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet
-
- Benson, Mikael (författare)
- Östergötlands Läns Landsting,Linköpings universitet,Avdelningen för kliniska vetenskaper,Hälsouniversitetet,Allergicentrum US,Barn- och ungdomskliniken i Linköping
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2014-01-02
- 2014
- Engelska.
-
Ingår i: PLoS Genetics. - : Public Library of Science (PLoS). - 1553-7390 .- 1553-7404. ; 10:1
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://journals.plo...
-
http://publications.... (primary) (free)
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Altered DNA methylation patterns in CD4+ T-cells indicate the importance of epigenetic mechanisms in inflammatory diseases. However, the identification of these alterations is complicated by the heterogeneity of most inflammatory diseases. Seasonal allergic rhinitis (SAR) is an optimal disease model for the study of DNA methylation because of its well-defined phenotype and etiology. We generated genome-wide DNA methylation (Npatients = 8, Ncontrols = 8) and gene expression (Npatients = 9, Ncontrols = 10) profiles of CD4+ T-cells from SAR patients and healthy controls using Illumina's HumanMethylation450 and HT-12 microarrays, respectively. DNA methylation profiles clearly and robustly distinguished SAR patients from controls, during and outside the pollen season. In agreement with previously published studies, gene expression profiles of the same samples failed to separate patients and controls. Separation by methylation (Npatients = 12, Ncontrols = 12), but not by gene expression (Npatients = 21, Ncontrols = 21) was also observed in an in vitro model system in which purified PBMCs from patients and healthy controls were challenged with allergen. We observed changes in the proportions of memory T-cell populations between patients (Npatients = 35) and controls (Ncontrols = 12), which could explain the observed difference in DNA methylation. Our data highlight the potential of epigenomics in the stratification of immune disease and represents the first successful molecular classification of SAR using CD4+ T cells.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- DNA methylation
- Epigenetics
- Gene expression
- Memory T cells
- Methylation
- Microarrays
- Pollen
- T cells
- Pollen
- MEDICINE
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Nestor, Colm
-
Barrenäs, Fredri ...
-
Wang, Hui
-
Lentini, Antonio
-
Zhang, Huan
-
Bruhn, Sören
-
visa fler...
-
Jörnsten, Rebeck ...
-
Langston, M.A.
-
Rogers, G.
-
Gustafsson, Mika
-
Benson, Mikael
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
- Artiklar i publikationen
-
PLoS Genetics
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Linköpings universitet