Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/219964" >
MEG3 long noncoding...
MEG3 long noncoding RNA regulates the TGF-β pathway genes through formation of RNA–DNA triplex structures
-
- Mondal, Tanmoy, 1981 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- Subhash, Santhilal, 1987 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- Vaid, Roshan (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
visa fler...
-
- Enroth, Stefan (författare)
- Uppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Gyllensten
-
- Uday, Sireesha (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- Reinius, Björn (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- Mitra, Sanhita (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- Mohammed, Arif (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- James, Alva Rani, 1987 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
- Hoberg, Emily, 1986 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology,University of Gothenburg
-
- Moustakas, Aristidis (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Ludwiginstitutet för cancerforskning
-
- Gyllensten, Ulf (författare)
- Uppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik
-
Jones, Steven J.M. (författare)
-
- Gustafsson, Claes M, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology,University of Gothenburg
-
- Sims, Andrew H (författare)
- University of Edinburgh
-
- Westerlund, Fredrik, 1978 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Gorab, Eduardo (författare)
- Universidade de Sao Paulo (USP),University of Sao Paulo (USP)
-
- Kanduri, Chandrasekhar, 1967 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics,University of Gothenburg
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015-07-24
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 6
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
http://publications.... (primary) (free)
-
https://doi.org/10.1...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Long noncoding RNAs (lncRNAs) regulate gene expression by association with chromatin, but how they target chromatin remains poorly understood. We have used chromatin RNA immunoprecipitation-coupled high-throughput sequencing to identify 276 lncRNAs enriched in repressive chromatin from breast cancer cells. Using one of the chromatin-interacting lncRNAs, MEG3, we explore the mechanisms by which lncRNAs target chromatin. Here we show that MEG3 and EZH2 share common target genes, including the TGF-β pathway genes. Genome-wide mapping of MEG3 binding sites reveals that MEG3 modulates the activity of TGF-β genes by binding to distal regulatory elements. MEG3 binding sites have GA-rich sequences, which guide MEG3 to the chromatin through RNA–DNA triplex formation. We have found that RNA–DNA triplex structures are widespread and are present over the MEG3 binding sites associated with the TGF-β pathway genes. Our findings suggest that RNA–DNA triplex formation could be a general characteristic of target gene recognition by the chromatin-interacting lncRNAs.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Medicinteknik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Medical Engineering (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- 'Long non coding RNAs'
- 'MEG3'
- 'noncoding'
- 'Long non coding RNAs'
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Mondal, Tanmoy, ...
-
Subhash, Santhil ...
-
Vaid, Roshan
-
Enroth, Stefan
-
Uday, Sireesha
-
Reinius, Björn
-
visa fler...
-
Mitra, Sanhita
-
Mohammed, Arif
-
James, Alva Rani ...
-
Hoberg, Emily, 1 ...
-
Moustakas, Arist ...
-
Gyllensten, Ulf
-
Jones, Steven J. ...
-
Gustafsson, Clae ...
-
Sims, Andrew H
-
Westerlund, Fred ...
-
Gorab, Eduardo
-
Kanduri, Chandra ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Medicinteknik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Uppsala universitet