Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/221883" >
Quantifying Diet-In...
Quantifying Diet-Induced Metabolic Changes of the Human Gut Microbiome
-
- Shoaie, Saeed, 1985 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Inserm Transfert SA,Assistance publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP)
-
- Ghaffari Nouran, Pouyan, 1980 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Kovatcheva-Datchary, Petia (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberglaboratoriet,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Wallenberg Laboratory,University of Gothenburg
-
visa fler...
-
- Mardinoglu, Adil, 1982 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Sen, Partho, 1983 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Pujos-Guillot, E. (författare)
- INRA Centre de Clermont-Ferrand-Theix
-
- de Wouters, T. (författare)
- Microbiologie de l'Alimentation au Service de la Sante Humaine
-
- Juste, C. (författare)
- Microbiologie de l'Alimentation au Service de la Sante Humaine,Imperial College of Science, Technology and Medicine
-
Rizkalla, S. (författare)
-
Chilloux, J. (författare)
-
- Hoyles, L. (författare)
- Imperial College of Science, Technology and Medicine
-
- Nicholson, J. K. (författare)
- Imperial College of Science, Technology and Medicine
-
- Dore, J. (författare)
- Microbiologie de l'Alimentation au Service de la Sante Humaine
-
- Dumas, M. E. (författare)
- Imperial College of Science, Technology and Medicine
-
- Clement, K. (författare)
- Assistance publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP),Inserm Transfert SA
-
- Bäckhed, Fredrik, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberglaboratoriet,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Wallenberg Laboratory,Köpenhamns universitet,University of Copenhagen,University of Gothenburg
-
- Nielsen, Jens B, 1962 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2015
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Cell Metabolism. - : Elsevier BV. - 1550-4131 .- 1932-7420. ; 22:2, s. 320-331
- Relaterad länk:
-
http://www.cell.com/...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The human gut microbiome is known to be associated with various human disorders, but a major challenge is to go beyond association studies and elucidate causalities. Mathematical modeling of the human gut microbiome at a genome scale is a useful tool to decipher microbe-microbe, diet-microbe and microbe-host interactions. Here, we describe the CASINO (Community And Systems-level INteractive Optimization) toolbox, a comprehensive computational platform for analysis of microbial communities through metabolic modeling. We first validated the toolbox by simulating and testing the performance of single bacteria and whole communities in vitro. Focusing on metabolic interactions between the diet, gut microbiota, and host metabolism, we demonstrated the predictive power of the toolbox in a diet-intervention study of 45 obese and overweight individuals and validated our predictions by fecal and blood metabolomics data. Thus, modeling could quantitatively describe altered fecal and serum amino acid levels in response to diet intervention.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Cellbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Shoaie, Saeed, 1 ...
-
Ghaffari Nouran, ...
-
Kovatcheva-Datch ...
-
Mardinoglu, Adil ...
-
Sen, Partho, 198 ...
-
Pujos-Guillot, E ...
-
visa fler...
-
de Wouters, T.
-
Juste, C.
-
Rizkalla, S.
-
Chilloux, J.
-
Hoyles, L.
-
Nicholson, J. K.
-
Dore, J.
-
Dumas, M. E.
-
Clement, K.
-
Bäckhed, Fredrik ...
-
Nielsen, Jens B, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Cellbiologi
- Artiklar i publikationen
-
Cell Metabolism
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola