Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/230168" >
Targeted high-throu...
Targeted high-throughput sequencing for genetic diagnostics of hemophagocytic lymphohistiocytosis
-
- Tesi, B. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Lagerstedt-Robinson, K. (författare)
- Karolinska Institutet
-
Chiang, S. C. C. (författare)
-
visa fler...
-
Ben Bdira, E. (författare)
-
Abboud, M. (författare)
-
Belen, B. (författare)
-
Devecioglu, O. (författare)
-
Fadoo, Z. (författare)
-
Yeoh, A. E. J. (författare)
-
Erichsen, H. C. (författare)
-
- Mottonen, M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
Akar, H. H. (författare)
-
Hastbacka, J. (författare)
-
Kaya, Z. (författare)
-
Nunes, S. (författare)
-
Patiroglu, T. (författare)
-
- Sabel, Magnus, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik,Institute of Clinical Sciences, Department of Pediatrics
-
Saribeyoglu, E. T. (författare)
-
Tvedt, T. H. (författare)
-
Unal, E. (författare)
-
Unal, S. (författare)
-
Unuvar, A. (författare)
-
Meeths, M. (författare)
-
- Henter, J. I. (författare)
- Karolinska Institutet
-
Nordenskjold, M. (författare)
-
Bryceson, Y. T. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015-12-18
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Genome Medicine. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1756-994X. ; 7:1
- Relaterad länk:
-
https://genomemedici...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Background: Hemophagocytic lymphohistiocytosis (HLH) is a rapid-onset, potentially fatal hyperinflammatory syndrome. A prompt molecular diagnosis is crucial for appropriate clinical management. Here, we validated and prospectively evaluated a targeted high-throughput sequencing approach for HLH diagnostics. Methods: A high-throughput sequencing strategy of 12 genes linked to HLH was validated in 13 patients with previously identified HLH-associated mutations and prospectively evaluated in 58 HLH patients. Moreover, 2504 healthy individuals from the 1000 Genomes project were analyzed in silico for variants in the same genes. Results: Analyses revealed a mutation detection sensitivity of 97.3 %, an average coverage per gene of 98.0 %, and adequate coverage over 98.6 % of sites previously reported as mutated in these genes. In the prospective cohort, we achieved a diagnosis in 22 out of 58 patients (38 %). Genetically undiagnosed HLH patients had a later age at onset and manifested higher frequencies of known secondary HLH triggers. Rare, putatively pathogenic monoallelic variants were identified in nine patients. However, such monoallelic variants were not enriched compared with healthy individuals. Conclusions: We have established a comprehensive high-throughput platform for genetic screening of patients with HLH. Almost all cases with reduced natural killer cell function received a diagnosis, but the majority of the prospective cases remain genetically unexplained, highlighting genetic heterogeneity and environmental impact within HLH. Moreover, in silico analyses of the genetic variation affecting HLH-related genes in the general population suggest caution with respect to interpreting causality between monoallelic mutations and HLH. A complete understanding of the genetic susceptibility to HLH thus requires further in-depth investigations, including genome sequencing and detailed immunological characterization.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- chediak-higashi-syndrome
- griscelli syndrome type-2
- t-cell
- primary
- immunodeficiencies
- rab27a mutations
- adult-onset
- deficiency
- protein
- perforin
- munc13-4
- Genetics & Heredity
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Tesi, B.
-
Lagerstedt-Robin ...
-
Chiang, S. C. C.
-
Ben Bdira, E.
-
Abboud, M.
-
Belen, B.
-
visa fler...
-
Devecioglu, O.
-
Fadoo, Z.
-
Yeoh, A. E. J.
-
Erichsen, H. C.
-
Mottonen, M.
-
Akar, H. H.
-
Hastbacka, J.
-
Kaya, Z.
-
Nunes, S.
-
Patiroglu, T.
-
Sabel, Magnus, 1 ...
-
Saribeyoglu, E. ...
-
Tvedt, T. H.
-
Unal, E.
-
Unal, S.
-
Unuvar, A.
-
Meeths, M.
-
Henter, J. I.
-
Nordenskjold, M.
-
Bryceson, Y. T.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
- Artiklar i publikationen
-
Genome Medicine
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Karolinska Institutet