Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/240554" >
Elucidating selecti...
Elucidating selection processes for antibiotic resistance in sewage treatment plants using metagenomics
-
- Bengtsson-Palme, Johan, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe,University of Gothenburg
-
- Hammarén, Rickard (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Pal, Chandan (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe,University of Gothenburg
-
visa fler...
-
- Östman, Marcus (författare)
- Umeå universitet,Kemiska institutionen,Umeå University
-
- Björlenius, Berndt (författare)
- KTH,Industriell bioteknologi,Kungliga Tekniska Högskolan (KTH),Royal Institute of Technology (KTH)
-
- Flach, Carl-Fredrik, 1977 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Fick, Jerker (författare)
- Umeå universitet,Kemiska institutionen,Göteborgs universitet,University of Gothenburg
-
- Kristiansson, Erik, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg
-
- Tysklind, Mats (författare)
- Umeå universitet,Kemiska institutionen,Umeå University
-
- Larsson, D. G. Joakim, 1969 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2016
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Science of the Total Environment. - : Elsevier BV. - 0048-9697 .- 1879-1026. ; 572, s. 697-712
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://research.cha...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Sewage treatment plants (STPs) have repeatedly been suggested as “hotspots” for the emergence and dissemination of antibiotic-resistant bacteria. A critical question still unanswered is if selection pressures within STPs, caused by residual antibiotics or other co-selective agents, are sufficient to specifically promote resistance. To address this, we employed shotgun metagenomic sequencing of samples from different steps of the treatment process in three Swedish STPs. In parallel, concentrations of selected antibiotics, biocides and metals were analyzed. We found that concentrations of tetracycline and ciprofloxacin in the influent were above predicted concentrations for resistance selection, however, there was no consistent enrichment of resistance genes to any particular class of antibiotics in the STPs, neither for biocide and metal resistance genes. The most substantial change of the bacterial communities compared to human feces occurred already in the sewage pipes, manifested by a strong shift from obligate to facultative anaerobes. Through the treatment process, resistance genes against antibiotics, biocides and metals were not reduced to the same extent as fecal bacteria. The OXA-48 gene was consistently enriched in surplus and digested sludge. We find this worrying as OXA-48, still rare in Swedish clinical isolates, provides resistance to carbapenems, one of our most critically important classes of antibiotics. Taken together, metagenomics analyses did not provide clear support for specific antibiotic resistance selection. However, stronger selective forces affecting gross taxonomic composition, and with that resistance gene abundances, limit interpretability. Comprehensive analyses of resistant/non-resistant strains within relevant species are therefore warranted.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Miljöbioteknik -- Vattenbehandling (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Environmental Biotechnology -- Water Treatment (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Kemi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Chemical Sciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
Nyckelord
- Antibiotic resistance genes
- Co-selection
- Fecal bacteria
- Microbial ecology
- Risk assessment
- Wastewater treatment
- Antibiotic resistance genes
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bengtsson-Palme, ...
-
Hammarén, Rickar ...
-
Pal, Chandan
-
Östman, Marcus
-
Björlenius, Bern ...
-
Flach, Carl-Fred ...
-
visa fler...
-
Fick, Jerker
-
Kristiansson, Er ...
-
Tysklind, Mats
-
Larsson, D. G. J ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Infektionsmedici ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Mikrobiologi
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Miljöbioteknik
-
och Vattenbehandling
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Kemi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
Science of the T ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Umeå universitet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Chalmers tekniska högskola
-
Karolinska Institutet