Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/240555" >
FARAO: the flexible...
FARAO: the flexible all-round annotation organizer
-
- Hammarén, Rickard (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
-
- Pal, Chandan (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe
-
- Bengtsson-Palme, Johan, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
-
(creator_code:org_t)
- 2016-08-04
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Bioinformatics. - : Oxford University Press (OUP). - 1367-4803 .- 1367-4811. ; 32:23, s. 3664-3666
- Relaterad länk:
-
https://academic.oup...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Summary: With decreasing costs of generating DNA sequence data, genome and metagenome projects have become accessible to a wider scientific community. However, to extract meaningful information and visualize the data remain challenging. We here introduce FARAO, a highly scalable software for organization, visualization and integration of annotation and read coverage data that can also combine output data from several bioinformatics tools. The capabilities of FARAO can greatly aid analyses of genomic and metagenomic datasets. Availability and Implementation: FARAO is implemented in Perl and is supported under Unix-like operative systems, including Linux and macOS. The Perl source code is freely available for download under the MIT License from http://microbiology.se/software/farao/.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Annan biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Other Biological Topics (hsv//eng)
Nyckelord
- Annotation
- Genomics
- Metagenomics
- Visualization
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas