Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/259965" >
Minimal methylation...
Minimal methylation classifier (MIMIC): A novel method for derivation and rapid diagnostic detection of disease-associated DNA methylation signatures
-
Schwalbe, E. C. (författare)
-
Hicks, D. (författare)
-
Rafiee, G. (författare)
-
visa fler...
-
Bashton, M. (författare)
-
Gohlke, H. (författare)
-
Enshaei, A. (författare)
-
Potluri, S. (författare)
-
Matthiesen, J. (författare)
-
Mather, M. (författare)
-
Taleongpong, P. (författare)
-
Chaston, R. (författare)
-
Silmon, A. (författare)
-
Curtis, A. (författare)
-
Lindsey, J. C. (författare)
-
Crosier, S. (författare)
-
Smith, A. J. (författare)
-
Goschzik, T. (författare)
-
Doz, F. (författare)
-
Rutkowski, S. (författare)
-
- Lannering, Birgitta, 1948 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik,Institute of Clinical Sciences, Department of Pediatrics
-
Pietsch, T. (författare)
-
Bailey, S. (författare)
-
Williamson, D. (författare)
-
Clifford, S. C. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-10-18
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Reports. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2045-2322. ; 7
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Rapid and reliable detection of disease-associated DNA methylation patterns has major potential to advance molecular diagnostics and underpin research investigations. We describe the development and validation of minimal methylation classifier (MIMIC), combining CpG signature design from genome-wide datasets, multiplex-PCR and detection by single-base extension and MALDI-TOF mass spectrometry, in a novel method to assess multi-locus DNA methylation profiles within routine clinically-applicable assays. We illustrate the application of MIMIC to successfully identify the methylation-dependent diagnostic molecular subgroups of medulloblastoma (the most common malignant childhood brain tumour), using scant/low-quality samples remaining from the most recently completed pan-European medulloblastoma clinical trial, refractory to analysis by conventional genome-wide DNA methylation analysis. Using this approach, we identify critical DNA methylation patterns from previously inaccessible cohorts, and reveal novel survival differences between the medulloblastoma disease subgroups with significant potential for clinical exploitation.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- tof mass-spectrometry
- medulloblastoma
- identification
- subgroups
- trial
- risk
- Science & Technology - Other Topics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Schwalbe, E. C.
-
Hicks, D.
-
Rafiee, G.
-
Bashton, M.
-
Gohlke, H.
-
Enshaei, A.
-
visa fler...
-
Potluri, S.
-
Matthiesen, J.
-
Mather, M.
-
Taleongpong, P.
-
Chaston, R.
-
Silmon, A.
-
Curtis, A.
-
Lindsey, J. C.
-
Crosier, S.
-
Smith, A. J.
-
Goschzik, T.
-
Doz, F.
-
Rutkowski, S.
-
Lannering, Birgi ...
-
Pietsch, T.
-
Bailey, S.
-
Williamson, D.
-
Clifford, S. C.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Repor ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet