Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/294939" >
Genomewide Associat...
Genomewide Association Study of Acute Anterior Uveitis Identifies New Susceptibility Loci
-
Huang, X. F. (författare)
-
Li, Z. X. (författare)
-
De Guzman, E. (författare)
-
visa fler...
-
Robinson, P. (författare)
-
Gensler, L. (författare)
-
Ward, M. M. (författare)
-
Rahbar, M. H. (författare)
-
Lee, M. (författare)
-
Weisman, M. H. (författare)
-
Macfarlane, G. J. (författare)
-
Jones, G. T. (författare)
-
- Klingberg, Eva (författare)
- Umeå universitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för reumatologi och inflammationsforskning,Institute of Medicine, Department of Rheumatology and Inflammation Research,Reumatologi
-
- Forsblad d'Elia, Helena, 1961 (författare)
- Umeå universitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för reumatologi och inflammationsforskning,Institute of Medicine, Department of Rheumatology and Inflammation Research,Reumatologi
-
McCluskey, P. (författare)
-
Wakefield, D. (författare)
-
Coombes, J. S. (författare)
-
Singh, M. A. F. (författare)
-
Mavros, Y. (författare)
-
Vlahovich, N. (författare)
-
Hughes, D. C. (författare)
-
Marzo-Ortega, H. (författare)
-
Van der Horste-Bruinsma, I. (författare)
-
O'Shea, F. (författare)
-
Martin, T. M. (författare)
-
Rosenbaum, J. (författare)
-
Breban, M. (författare)
-
Jin, Z. B. (författare)
-
Leo, P. (författare)
-
Reveille, J. D. (författare)
-
Wordsworth, B. P. (författare)
-
Brown, M. A. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Association for Research in Vision and Ophthalmology (ARVO), 2020
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Investigative Ophthalmology & Visual Science. - : Association for Research in Vision and Ophthalmology (ARVO). - 0146-0404 .- 1552-5783. ; 61:6
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- PURPOSE. Acute anterior uveitis (AAU) is a common intraocular inflammatory disease. AAU occurs in 30% to 50% of patients with ankylosing spondylitis (AS), and both conditions are strongly associated with human leukocyte antigen (HLA)-B 27 , implying a shared etiology. This study aims to apply genomewide association study (GWAS) to characterize the genetic associations of AAU and their relationship to the genetics of AS. METHODS. We undertook the GWAS analyses in 2752 patients with AS with AAU (cases) and 3836 patients with AS without AAU (controls). There were 7,436,415 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) available alter SNP microarray genotyping, imputation, and quality-control filtering. RESULTS. We identified one locus associated with AAU at genomewide significance: rs9378248 (P = 2.69 x 10(-8), odds ratio [OR] = 0.78), lying close to HLA-B. Suggestive association was observed at 11 additional loci, including previously reported AS loci ERAP1 (rs27529, P = 2.19 x 10(-7), OR = 1.22) and NOS2 (rs2274894, P = 8.22 x 10(-7), OR = 0.83). Multiple novel suggestive associations were also identified, including MERTK (rsl0171979, P = 2.56 x 10(-6), OR = 1.20), KIFAP3 (rs508063, P = 5.64 x 10(-7), OR = 1.20), CLCN7 (rs67412457, P = 1.33 x 10(-6), OR = 1.25), ACAA2 (rs9947182, P = 9.70 x 10(-7), OR = 1.37), and 5 intergenic loci. The SNP-based heritability is approximately 0.5 for AS alone, and is much higher (approximately 0.7) for AS with AAU. Consistent with the high heritability, a genomewide polygenic risk score shows strong power in identifying individuals at high risk of either AS with AAU or AS alone. CONCLUSIONS. We report here the first GWAS for AAU and identify new susceptibility loci. Our findings confirm the strong overlap in etiopathogenesis of AAU with AS, and also provide new insights into the genetic basis of AAU.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Oftalmologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Ophthalmology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Reumatologi och inflammation (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Rheumatology and Autoimmunity (hsv//eng)
Nyckelord
- acute anterior uveitis
- ankylosing spondylitis
- GWAS
- heritability
- genetic risk scores
- ankylosing-spondylitis
- wide association
- gene-expression
- population
- protooncogene
- epidemiology
- prediction
- discovery
- variants
- hla-b27
- Ophthalmology
- acute anterior uveitis
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Huang, X. F.
-
Li, Z. X.
-
De Guzman, E.
-
Robinson, P.
-
Gensler, L.
-
Ward, M. M.
-
visa fler...
-
Rahbar, M. H.
-
Lee, M.
-
Weisman, M. H.
-
Macfarlane, G. J ...
-
Jones, G. T.
-
Klingberg, Eva
-
Forsblad d'Elia, ...
-
McCluskey, P.
-
Wakefield, D.
-
Coombes, J. S.
-
Singh, M. A. F.
-
Mavros, Y.
-
Vlahovich, N.
-
Hughes, D. C.
-
Marzo-Ortega, H.
-
Van der Horste-B ...
-
O'Shea, F.
-
Martin, T. M.
-
Rosenbaum, J.
-
Breban, M.
-
Jin, Z. B.
-
Leo, P.
-
Reveille, J. D.
-
Wordsworth, B. P ...
-
Brown, M. A.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Oftalmologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Reumatologi och ...
- Artiklar i publikationen
-
Investigative Op ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Umeå universitet