Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/321701" >
Duplex Sequencing U...
Duplex Sequencing Uncovers Recurrent Low-frequency Cancer-associated Mutations in Infant and Childhood KMT2A-rearranged Acute Leukemia
-
Pilheden, M. (författare)
-
Ahlgren, L. (författare)
-
Hyrenius-Wittsten, A. (författare)
-
visa fler...
-
Gonzalez-Pena, V. (författare)
-
Sturesson, H. (författare)
-
Marquart, H. V. H. (författare)
-
Lausen, B. (författare)
-
Castor, A. (författare)
-
Pronk, C. J. (författare)
-
Barbany, G. (författare)
-
Tamm, K. P. (författare)
-
- Fogelstrand, Linda, 1974 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
Lohi, O. (författare)
-
Noren-Nystrom, U. (författare)
-
Asklin, J. (författare)
-
Chen, Y. L. (författare)
-
Song, G. C. (författare)
-
Walsh, M. (författare)
-
Ma, J. (författare)
-
Zhang, J. H. (författare)
-
Saal, L. H. (författare)
-
Gawad, C. (författare)
-
Hagstrom-Andersson, A. K. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-10
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Hemasphere. - : Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health). - 2572-9241. ; 6:10
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Infant acute lymphoblastic leukemia (ALL) with KMT2A-gene rearrangements (KMT2A-r) have few mutations and a poor prognosis. To uncover mutations that are below the detection of standard next-generation sequencing (NGS), a combination of targeted duplex sequencing and NGS was applied on 20 infants and 7 children with KMT2A-r ALL, 5 longitudinal and 6 paired relapse samples. Of identified nonsynonymous mutations, 87 had been previously implicated in cancer and targeted genes recurrently altered in KMT2A-r leukemia and included mutations in KRAS, NRAS, FLT3, TP53, PIK3CA, PAX5, PIK3R1, and PTPN11, with infants having fewer such mutations. Of identified cancer-associated mutations, 62% were below the resolution of standard NGS. Only 33 of 87 mutations exceeded 2% of cellular prevalence and most-targeted PI3K/RAS genes (31/33) and typically KRAS/NRAS. Five patients only had low-frequency PI3K/RAS mutations without a higher-frequency signaling mutation. Further, drug-resistant clones with FLT3(D835H) or NRAS(G13D/G12S) mutations that comprised only 0.06% to 0.34% of diagnostic cells, expanded at relapse. Finally, in longitudinal samples, the relapse clone persisted as a minor subclone from diagnosis and through treatment before expanding during the last month of disease. Together, we demonstrate that infant and childhood KMT2A-r ALL harbor low-frequency cancer-associated mutations, implying a vast subclonal genetic landscape.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Hematologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Hematology (hsv//eng)
Nyckelord
- acute lymphoblastic-leukemia
- ras pathway
- model
- adolescents
- landscape
- children
- survival
- mll-af9
- markers
- DNA
- Hematology
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Pilheden, M.
-
Ahlgren, L.
-
Hyrenius-Wittste ...
-
Gonzalez-Pena, V ...
-
Sturesson, H.
-
Marquart, H. V. ...
-
visa fler...
-
Lausen, B.
-
Castor, A.
-
Pronk, C. J.
-
Barbany, G.
-
Tamm, K. P.
-
Fogelstrand, Lin ...
-
Lohi, O.
-
Noren-Nystrom, U ...
-
Asklin, J.
-
Chen, Y. L.
-
Song, G. C.
-
Walsh, M.
-
Ma, J.
-
Zhang, J. H.
-
Saal, L. H.
-
Gawad, C.
-
Hagstrom-Anderss ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Hematologi
- Artiklar i publikationen
-
Hemasphere
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet