SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:23488743-b6a5-438e-8d1f-7c71d3f89d57"
 

Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:23488743-b6a5-438e-8d1f-7c71d3f89d57" > Proteogenomics and ...

Proteogenomics and Hi-C reveal transcriptional dysregulation in high hyperdiploid childhood acute lymphoblastic leukemia

Yang, Minjun (författare)
Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
Vesterlund, Mattias (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Siavelis, Ioannis (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
visa fler...
Moura-Castro, Larissa H. (författare)
Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
Castor, Anders (författare)
Lund University,Lunds universitet,Pediatrik, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Paediatrics (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
Fioretos, Thoas (författare)
Lund University,Lunds universitet,Translationella genomiska och funktionella studier av leukemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Genomic and Functional Studies of Leukemia,Lund University Research Groups
Jafari, Rozbeh (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Lilljebjörn, Henrik (författare)
Lund University,Lunds universitet,Translationella genomiska och funktionella studier av leukemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Genomic and Functional Studies of Leukemia,Lund University Research Groups
Odom, Duncan T. (författare)
German Cancer Research Centre,University of Cambridge
Olsson, Linda (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genetiska och epigenetiska studier av barnleukemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and epigenetic studies of pediatric leukemia,Lund University Research Groups
Ravi, Naveen (författare)
Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
Woodward, Eleanor L. (författare)
Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
Harewood, Louise (författare)
Queen's University Belfast,University of Cambridge
Lehtiö, Janne (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institute
Paulsson, Kajsa (författare)
Lund University,Lunds universitet,Aneuploidi i cancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Aneuploidy in cancer,Lund University Research Groups
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2019-04-03
2019
Engelska.
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 10:1
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10... (free)
visa fler...
https://www.nature.c...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
http://kipublication...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Hyperdiploidy, i.e. gain of whole chromosomes, is one of the most common genetic features of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), but its pathogenetic impact is poorly understood. Here, we report a proteogenomic analysis on matched datasets from genomic profiling, RNA-sequencing, and mass spectrometry-based analysis of >8,000 genes and proteins as well as Hi-C of primary patient samples from hyperdiploid and ETV6/RUNX1-positive pediatric ALL. We show that CTCF and cohesin, which are master regulators of chromatin architecture, display low expression in hyperdiploid ALL. In line with this, a general genome-wide dysregulation of gene expression in relation to topologically associating domain (TAD) borders were seen in the hyperdiploid group. Furthermore, Hi-C of a limited number of hyperdiploid childhood ALL cases revealed that 2/4 cases displayed a clear loss of TAD boundary strength and 3/4 showed reduced insulation at TAD borders, with putative leukemogenic effects.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Pediatrik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Pediatrics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy