SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:2465df78-5ac8-4039-a7c3-ec4388391f53"
 

Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:2465df78-5ac8-4039-a7c3-ec4388391f53" > Visualizing the ent...

Visualizing the entire DNA from a chromosome in a single frame

Freitag, C. (författare)
Gothenburg University,University of Gothenburg,Lund University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
Noble, Charleston (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
Fritzsche, Joachim, 1977 (författare)
Gothenburg University,University of Gothenburg,Chalmers University of Technology,Göteborgs universitet,Chalmers tekniska högskola,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
visa fler...
Persson, Fredrik, 1979 (författare)
Uppsala universitet,Gothenburg University,Uppsala University,University of Gothenburg,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU),Beräknings- och systembiologi
Reiter-Schad, Michaela (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
Nilsson, Adam (författare)
Lund University,Lunds universitet,Atomfysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Atomic Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Graneli, Annette, 1973 (författare)
Gothenburg University,University of Gothenburg,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
Ambjörnsson, Tobias (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
Mir, K. U. (författare)
University of Oxford,Harvard University,Wellcome Trust Centre for Human Genetics
Tegenfeldt, Jonas (författare)
Gothenburg University,University of Gothenburg,Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
AIP Publishing, 2015
2015
Engelska.
Ingår i: Biomicrofluidics. - : AIP Publishing. - 1932-1058. ; 9:4
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10... (free)
visa fler...
https://aip.scitatio...
http://publications.... (primary) (free)
https://gup.ub.gu.se... (primary) (free)
https://doi.org/10.1...
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
https://research.cha...
https://gup.ub.gu.se...
https://urn.kb.se/re...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The contiguity and phase of sequence information are intrinsic to obtain complete understanding of the genome and its relationship to phenotype. We report the fabrication and application of a novel nanochannel design that folds megabase lengths of genomic DNA into a systematic back-and-forth meandering path. Such meandering nanochannels enabled us to visualize the complete 5.7 Mbp (1mm) stained DNA length of a Schizosaccharomyces pombe chromosome in a single frame of a CCD. We were able to hold the DNA in situ while implementing partial denaturation to obtain a barcode pattern that we could match to a reference map using the Poland-Scheraga model for DNA melting. The facility to compose such long linear lengths of genomic DNA in one field of view enabled us to directly visualize a repeat motif, count the repeat unit number, and chart its location in the genome by reference to unique barcode motifs found at measurable distances from the repeat. Meandering nanochannel dimensions can easily be tailored to human chromosome scales, which would enable the whole genome to be visualized in seconds. (C) 2015 Author(s). All article content, except where otherwise noted, is licensed under a Creative Commons Attribution 3.0 Unported License.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biofysik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biophysics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Fysik -- Annan fysik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Physical Sciences -- Other Physics Topics (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik -- Medicinsk bildbehandling (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering -- Medical Image Processing (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy