Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:29bda5f4-e7fc-4397-b745-b1151f59c03f" >
Promoter-associated...
Promoter-associated proteins of EPAS1 identified by enChIP-MS – A putative role of HDX as a negative regulator
-
- Hamidian, Arash (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- Vaapil, Marica (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- von Stedingk, Kristoffer (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Pediatrik, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Paediatrics (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
visa fler...
-
- Fujita, Toshitsugu (författare)
- Hirosaki University,Osaka University
-
- Persson, Camilla U. (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- Eriksson, Pontus (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Veerla, Srinivas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- De Preter, Katleen (författare)
- Ghent University Hospital
-
- Speleman, Frank (författare)
- Ghent University Hospital
-
- Fujii, Hodaka (författare)
- Hirosaki University,Osaka University
-
- Påhlman, Sven (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- Mohlin, Sofie (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Malmö,Faculty of Medicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2018
- 2018
- Engelska 8 s.
-
Ingår i: Biochemical and Biophysical Research Communications. - : Elsevier BV. - 0006-291X. ; 499:2, s. 291-298
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Presence of perivascular neuroblastoma cells with high expression of hypoxia inducible factor (HIF)-2α correlates with distant metastasis and aggressive disease. Regulation of HIFs are traditionally considered to occur post-translationally, but we have recently shown that HIF-2α is unconventionally regulated also at the transcriptional level in neuroblastoma cells. Regulatory factors binding directly to EPAS1 (encoding HIF-2α) to promote transcription are yet to be defined. Here, we employ the novel CRISPR/Cas9-based engineered DNA-binding molecule-mediated chromatin immunoprecipitation (enChIP) – mass spectrometry (MS) methodology to, in an unbiased fashion, identify proteins that associate with the EPAS1 promoter under normoxic and hypoxic conditions. Our enChIP analysis resulted in 27 proteins binding to the EPAS1 promoter in neuroblastoma cells. In agreement with a general hypoxia-driven downregulation of gene transcription, the majority (24 out of 27) of proteins dissociate from the promoter at hypoxia. Among them were several nucleosome-associated proteins suggesting a general opening of chromatin as one explanation to induced EPAS1 transcription at hypoxia. Of particular interest from the list of released factors at hypoxia was the highly divergent homeobox (HDX) transcription factor, that we show inversely correlates with HIF-2α in neuroblastoma cells. We propose a putative model where HDX negatively regulates EPAS1 expression through a release-of-inhibition mechanism.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- enChIP
- HDX
- HIF-2α
- Hypoxia
- MYCN
- Neuroblastoma
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Hamidian, Arash
-
Vaapil, Marica
-
von Stedingk, Kr ...
-
Fujita, Toshitsu ...
-
Persson, Camilla ...
-
Eriksson, Pontus
-
visa fler...
-
Veerla, Srinivas
-
De Preter, Katle ...
-
Speleman, Frank
-
Fujii, Hodaka
-
Påhlman, Sven
-
Mohlin, Sofie
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Biochemical and ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet