Exome array analysis of ischaemic stroke : results from a southern Swedish study

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:54d70dc0-2154-4a66-a91a-d82193e6cbb2" > Exome array analysi...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Exome array analysis of ischaemic stroke : results from a southern Swedish study

Söderholm, M (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Almgren, P (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

Jood, Katarina, 1966 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation

visa fler...

Stanne, Tara M, 1979 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology

Olsson, Mats (författare): University of Gothenburg

Ilinca, A (författare): Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital

Lorentzen, Erik, 1974 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Core Facilities, Bioinformatics,Core Facilities, Bioinformatics

Norrving, B (författare): Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital

Engström, G (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups

Melander, O (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups

Jern, Christina, 1962 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology

Lindgren, Arne (författare): Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Klinisk strokeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Clinical Stroke Research Group,Lund University Research Groups

Olsson, Maja, 1975 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology

visa färre...

(creator_code:org_t)

2016-07-29
2016
Engelska 7 s.
Ingår i: European Journal of Neurology. - : Wiley. - 1351-5101 .- 1468-1331. ; 23:12, s. 1722-1728

Relaterad länk:: http://onlinelibrary...; visa fler...; http://dx.doi.org/10...; https://lup.lub.lu.s...; https://doi.org/10.1...; https://gup.ub.gu.se...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

BACKGROUND AND PURPOSE: Genome-wide association (GWA) studies have identified a few risk loci for ischaemic stroke, but these variants explain only a small part of the genetic contribution to the disease. Coding variants associated with amino acid substitutions or premature termination of protein synthesis could have a large effect on disease risk. We performed an exome array analysis for ischaemic stroke.METHODS: Patients with ischaemic stroke (n = 2385) and control subjects (n = 6077) from three Swedish studies were genotyped with the Illumina HumanOmniExpressExome BeadChip. Single-variant association analysis and gene-based tests were performed of exome variants with minor allele frequency of < 5%. A separate GWA analysis was also performed, based on 700 000 genotyped common markers and subsequent imputation.RESULTS: No exome variant or gene was significantly associated with all ischaemic stroke after Bonferroni correction (all P > 1.8 × 10(-6) for single-variant and >4.15 × 10(-6) for gene-based analysis). The strongest association in single-variant analysis was found for a missense variant in the DNAH11 gene (rs143362381; P = 5.01 × 10(-6) ). In gene-based tests, the strongest association was for the ZBTB20 gene (P = 7.9 × 10(-5) ). The GWA analysis showed that the sample was homogenous (median genomic inflation factor = 1.006). No genome-wide significant association with overall ischaemic stroke risk was found. However, previously reported associations for the PITX2 and ZFHX3 gene loci with cardioembolic stroke subtype were replicated (P = 7 × 10(-15) and 6 × 10(-3) ).CONCLUSIONS: This exome array analysis did not identify any single variants or genes reaching the pre-defined significance level for association with ischaemic stroke. Further studies on exome variants should be performed in even larger, well-defined and subtyped samples.

Hitta via bibliotek

European Journal of Neurology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Söderholm, M; Almgren, P; Jood, Katarina, ...; Stanne, Tara M, ...; Olsson, Mats; Ilinca, A; visa fler...; Lorentzen, Erik, ...; Norrving, B; Engström, G; Melander, O; Jern, Christina, ...; Lindgren, Arne; Olsson, Maja, 19 ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Neurovetenskaper

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...

Artiklar i publikationen: European Journal ...

Av lärosätet: Lunds universitet; Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Exome array analysis of ischaemic stroke : results from a southern Swedish study

Ämnesord

Nyckelord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub