Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:84ecc4e4-6de4-48b1-8f7f-908d6c9e843d" >
EuroDia : a beta-ce...
EuroDia : a beta-cell gene expression resource.
-
- Liechti, Robin (författare)
- Swiss Institute for Bioinformatics (SIB)
-
Csárdi, Gábor (författare)
-
Bergmann, Sven (författare)
-
visa fler...
-
Schütz, Frédéric (författare)
-
Sengstag, Thierry (författare)
-
Boj, Sylvia F. (författare)
-
Servitja, Joan Marc (författare)
-
Ferrer, Jorge (författare)
-
Van Lommel, Leentje (författare)
-
Schuit, Frans (författare)
-
Klinger, Sonia (författare)
-
Thorens, Bernard (författare)
-
Naamane, Najib (författare)
-
Eizirik, Decio L. (författare)
-
Marselli, Lorella (författare)
-
Bugliani, Marco (författare)
-
Marchetti, Piero (författare)
-
- Lucas, Stephanie (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molecular Endocrinology,Lund University Research Groups
-
- Holm, Cecilia (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molecular Endocrinology,Lund University Research Groups
-
Jongeneel, C. Victor (författare)
-
Xenarios, Ioannis (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2010-10-12
- 2010
- Engelska.
-
Ingår i: Database: the journal of biological databases and curation. - : Oxford University Press (OUP). - 1758-0463. ; 2010
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a major disease affecting nearly 280 million people worldwide. Whilst the pathophysiological mechanisms leading to disease are poorly understood, dysfunction of the insulin-producing pancreatic beta-cells is key event for disease development. Monitoring the gene expression profiles of pancreatic beta-cells under several genetic or chemical perturbations has shed light on genes and pathways involved in T2DM. The EuroDia database has been established to build a unique collection of gene expression measurements performed on beta-cells of three organisms, namely human, mouse and rat. The Gene Expression Data Analysis Interface (GEDAI) has been developed to support this database. The quality of each dataset is assessed by a series of quality control procedures to detect putative hybridization outliers. The system integrates a web interface to several standard analysis functions from R/Bioconductor to identify differentially expressed genes and pathways. It also allows the combination of multiple experiments performed on different array platforms of the same technology. The design of this system enables each user to rapidly design a custom analysis pipeline and thus produce their own list of genes and pathways. Raw and normalized data can be downloaded for each experiment. The flexible engine of this database (GEDAI) is currently used to handle gene expression data from several laboratory-run projects dealing with different organisms and platforms. Database URL: http://eurodia.vital-it.ch.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Liechti, Robin
-
Csárdi, Gábor
-
Bergmann, Sven
-
Schütz, Frédéric
-
Sengstag, Thierr ...
-
Boj, Sylvia F.
-
visa fler...
-
Servitja, Joan M ...
-
Ferrer, Jorge
-
Van Lommel, Leen ...
-
Schuit, Frans
-
Klinger, Sonia
-
Thorens, Bernard
-
Naamane, Najib
-
Eizirik, Decio L ...
-
Marselli, Lorell ...
-
Bugliani, Marco
-
Marchetti, Piero
-
Lucas, Stephanie
-
Holm, Cecilia
-
Jongeneel, C. Vi ...
-
Xenarios, Ioanni ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Database: the jo ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet