Sökning: id:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:142920554" >
Comprehensive analy...
Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing
-
- Cortes-Ciriano, I (författare)
- Harvard Medical School
-
- Lee, JJK (författare)
- Harvard Medical School
-
- Xi, RB (författare)
- Peking University Cancer Hospital
-
visa fler...
-
- Jain, D (författare)
- Harvard Medical School
-
- Jung, YL (författare)
- Harvard Medical School,Loyola University Chicago
-
Yang, LX (författare)
-
- Gordenin, D (författare)
- National Human Genome Research Institute
-
- Klimczak, LJ (författare)
- National Human Genome Research Institute
-
- Zhang, CZ (författare)
- Broad Institute
-
- Pellman, DS (författare)
- Dana-Farber Cancer Institute
-
- Park, PJ (författare)
- Harvard Medical School
-
Akdemir, KC (författare)
-
Alvarez, EG (författare)
-
Baez-Ortega, A (författare)
-
Beroukhim, R (författare)
-
Boutros, PC (författare)
-
Bowtell, DDL (författare)
-
Brors, B (författare)
-
Burns, KH (författare)
-
Campbell, PJ (författare)
-
Chan, K (författare)
-
Chen, K (författare)
-
Dueso-Barroso, A (författare)
-
Dunford, AJ (författare)
-
Edwards, PA (författare)
-
Estivill, X (författare)
-
Etemadmoghadam, D (författare)
-
Feuerbach, L (författare)
-
Fink, JL (författare)
-
Frenkel-Morgenstern, M (författare)
-
Garsed, DW (författare)
-
Gerstein, M (författare)
-
Gordenin, DA (författare)
-
Haan, D (författare)
-
Haber, JE (författare)
-
Hess, JM (författare)
-
Hutter, B (författare)
-
Imielinski, M (författare)
-
Jones, DTW (författare)
-
Ju, YS (författare)
-
Kazanov, MD (författare)
-
Koh, Y (författare)
-
Korbel, JO (författare)
-
Kumar, K (författare)
-
Lee, EA (författare)
-
Li, YL (författare)
-
Lynch, AG (författare)
-
Macintyre, G (författare)
-
Markowetz, F (författare)
-
Martincorena, I (författare)
-
Martinez-Fundichely, A (författare)
-
Miyano, S (författare)
-
Nakagawa, H (författare)
-
Navarro, FCP (författare)
-
Ossowski, S (författare)
-
Pearson, J (författare)
-
Puiggros, M (författare)
-
Rippe, K (författare)
-
Roberts, ND (författare)
-
Roberts, SA (författare)
-
Rodriguez-Martin, B (författare)
-
Schumacher, SE (författare)
-
Scully, R (författare)
-
Shackleton, M (författare)
-
Sidiropoulos, N (författare)
-
Sieverling, L (författare)
-
Stewart, C (författare)
-
Torrents, D (författare)
-
Tubio, JMC (författare)
-
Villasante, I (författare)
-
Waddell, N (författare)
-
Wala, JA (författare)
-
Weischenfeldt, J (författare)
-
Yao, XT (författare)
-
Yoon, SS (författare)
-
Zamora, J (författare)
-
- Borg, Åke (creator_code:cre_t)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Ringnér, Markus (creator_code:cre_t)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
-
- Staaf, Johan (creator_code:cre_t)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2020-02-05
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Nature genetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1546-1718 .- 1061-4036. ; 52:3, s. 331-
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
http://kipublication...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Chromothripsis is a mutational phenomenon characterized by massive, clustered genomic rearrangements that occurs in cancer and other diseases. Recent studies in selected cancer types have suggested that chromothripsis may be more common than initially inferred from low-resolution copy-number data. Here, as part of the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium of the International Cancer Genome Consortium (ICGC) and The Cancer Genome Atlas (TCGA), we analyze patterns of chromothripsis across 2,658 tumors from 38 cancer types using whole-genome sequencing data. We find that chromothripsis events are pervasive across cancers, with a frequency of more than 50% in several cancer types. Whereas canonical chromothripsis profiles display oscillations between two copy-number states, a considerable fraction of events involve multiple chromosomes and additional structural alterations. In addition to non-homologous end joining, we detect signatures of replication-associated processes and templated insertions. Chromothripsis contributes to oncogene amplification and to inactivation of genes such as mismatch-repair-related genes. These findings show that chromothripsis is a major process that drives genome evolution in human cancer.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- Chromothripsis
- Evolution, Molecular
- Genome, Human/genetics
- Genomics
- Humans
- Mutation
- Neoplasms/genetics
- Whole Genome Sequencing
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Cortes-Ciriano, ...
-
Lee, JJK
-
Xi, RB
-
Jain, D
-
Jung, YL
-
Yang, LX
-
visa fler...
-
Gordenin, D
-
Klimczak, LJ
-
Zhang, CZ
-
Pellman, DS
-
Park, PJ
-
Akdemir, KC
-
Alvarez, EG
-
Baez-Ortega, A
-
Beroukhim, R
-
Boutros, PC
-
Bowtell, DDL
-
Brors, B
-
Burns, KH
-
Campbell, PJ
-
Chan, K
-
Chen, K
-
Dueso-Barroso, A
-
Dunford, AJ
-
Edwards, PA
-
Estivill, X
-
Etemadmoghadam, ...
-
Feuerbach, L
-
Fink, JL
-
Frenkel-Morgenst ...
-
Garsed, DW
-
Gerstein, M
-
Gordenin, DA
-
Haan, D
-
Haber, JE
-
Hess, JM
-
Hutter, B
-
Imielinski, M
-
Jones, DTW
-
Ju, YS
-
Kazanov, MD
-
Koh, Y
-
Korbel, JO
-
Kumar, K
-
Lee, EA
-
Li, YL
-
Lynch, AG
-
Macintyre, G
-
Markowetz, F
-
Martincorena, I
-
Martinez-Fundich ...
-
Miyano, S
-
Nakagawa, H
-
Navarro, FCP
-
Ossowski, S
-
Pearson, J
-
Puiggros, M
-
Rippe, K
-
Roberts, ND
-
Roberts, SA
-
Rodriguez-Martin ...
-
Schumacher, SE
-
Scully, R
-
Shackleton, M
-
Sidiropoulos, N
-
Sieverling, L
-
Stewart, C
-
Torrents, D
-
Tubio, JMC
-
Villasante, I
-
Waddell, N
-
Wala, JA
-
Weischenfeldt, J
-
Yao, XT
-
Yoon, SS
-
Zamora, J
-
Borg, Åke
-
Ringnér, Markus
-
Staaf, Johan
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature genetics
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet
-
Lunds universitet